Protein–RNA interactions for Protein: Q5M8N4

Sdr39u1, Epimerase family protein SDR39U1, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr39u1Q5M8N4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sdr39u1Q5M8N4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sdr39u1Q5M8N4 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sdr39u1Q5M8N4 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sdr39u1Q5M8N4 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdr39u1Q5M8N4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdr39u1Q5M8N4 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdr39u1Q5M8N4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdr39u1Q5M8N4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdr39u1Q5M8N4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdr39u1Q5M8N4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdr39u1Q5M8N4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdr39u1Q5M8N4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdr39u1Q5M8N4 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdr39u1Q5M8N4 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdr39u1Q5M8N4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdr39u1Q5M8N4 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdr39u1Q5M8N4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdr39u1Q5M8N4 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdr39u1Q5M8N4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdr39u1Q5M8N4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdr39u1Q5M8N4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdr39u1Q5M8N4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdr39u1Q5M8N4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdr39u1Q5M8N4 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdr39u1Q5M8N4 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdr39u1Q5M8N4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdr39u1Q5M8N4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdr39u1Q5M8N4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdr39u1Q5M8N4 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdr39u1Q5M8N4 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdr39u1Q5M8N4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdr39u1Q5M8N4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdr39u1Q5M8N4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdr39u1Q5M8N4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdr39u1Q5M8N4 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdr39u1Q5M8N4 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdr39u1Q5M8N4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdr39u1Q5M8N4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdr39u1Q5M8N4 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdr39u1Q5M8N4 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdr39u1Q5M8N4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdr39u1Q5M8N4 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdr39u1Q5M8N4 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdr39u1Q5M8N4 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdr39u1Q5M8N4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdr39u1Q5M8N4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdr39u1Q5M8N4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdr39u1Q5M8N4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdr39u1Q5M8N4 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdr39u1Q5M8N4 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdr39u1Q5M8N4 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdr39u1Q5M8N4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdr39u1Q5M8N4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdr39u1Q5M8N4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdr39u1Q5M8N4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdr39u1Q5M8N4 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdr39u1Q5M8N4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdr39u1Q5M8N4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdr39u1Q5M8N4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdr39u1Q5M8N4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdr39u1Q5M8N4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdr39u1Q5M8N4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdr39u1Q5M8N4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdr39u1Q5M8N4 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdr39u1Q5M8N4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdr39u1Q5M8N4 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdr39u1Q5M8N4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sdr39u1Q5M8N4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sdr39u1Q5M8N4 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sdr39u1Q5M8N4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sdr39u1Q5M8N4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sdr39u1Q5M8N4 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sdr39u1Q5M8N4 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdr39u1Q5M8N4 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdr39u1Q5M8N4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdr39u1Q5M8N4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdr39u1Q5M8N4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdr39u1Q5M8N4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdr39u1Q5M8N4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdr39u1Q5M8N4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdr39u1Q5M8N4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdr39u1Q5M8N4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdr39u1Q5M8N4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdr39u1Q5M8N4 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdr39u1Q5M8N4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdr39u1Q5M8N4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdr39u1Q5M8N4 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdr39u1Q5M8N4 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdr39u1Q5M8N4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdr39u1Q5M8N4 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdr39u1Q5M8N4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdr39u1Q5M8N4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdr39u1Q5M8N4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdr39u1Q5M8N4 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdr39u1Q5M8N4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdr39u1Q5M8N4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdr39u1Q5M8N4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdr39u1Q5M8N4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdr39u1Q5M8N4 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms