Protein–RNA interactions for Protein: Q5D525

Syce1l, Synaptonemal complex central element protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1lQ5D525 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syce1lQ5D525 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syce1lQ5D525 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syce1lQ5D525 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syce1lQ5D525 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syce1lQ5D525 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syce1lQ5D525 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syce1lQ5D525 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syce1lQ5D525 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syce1lQ5D525 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Syce1lQ5D525 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syce1lQ5D525 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syce1lQ5D525 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syce1lQ5D525 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syce1lQ5D525 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syce1lQ5D525 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syce1lQ5D525 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syce1lQ5D525 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syce1lQ5D525 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syce1lQ5D525 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syce1lQ5D525 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syce1lQ5D525 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syce1lQ5D525 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Syce1lQ5D525 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Syce1lQ5D525 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syce1lQ5D525 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syce1lQ5D525 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syce1lQ5D525 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syce1lQ5D525 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syce1lQ5D525 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syce1lQ5D525 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Syce1lQ5D525 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Syce1lQ5D525 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Syce1lQ5D525 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Syce1lQ5D525 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Syce1lQ5D525 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Syce1lQ5D525 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Syce1lQ5D525 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Syce1lQ5D525 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Syce1lQ5D525 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syce1lQ5D525 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syce1lQ5D525 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syce1lQ5D525 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syce1lQ5D525 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syce1lQ5D525 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syce1lQ5D525 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Syce1lQ5D525 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syce1lQ5D525 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syce1lQ5D525 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syce1lQ5D525 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syce1lQ5D525 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syce1lQ5D525 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syce1lQ5D525 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syce1lQ5D525 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syce1lQ5D525 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syce1lQ5D525 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syce1lQ5D525 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syce1lQ5D525 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syce1lQ5D525 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syce1lQ5D525 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syce1lQ5D525 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syce1lQ5D525 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syce1lQ5D525 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syce1lQ5D525 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syce1lQ5D525 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syce1lQ5D525 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syce1lQ5D525 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syce1lQ5D525 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syce1lQ5D525 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syce1lQ5D525 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Syce1lQ5D525 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syce1lQ5D525 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syce1lQ5D525 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syce1lQ5D525 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syce1lQ5D525 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syce1lQ5D525 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syce1lQ5D525 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syce1lQ5D525 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syce1lQ5D525 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Syce1lQ5D525 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syce1lQ5D525 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syce1lQ5D525 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syce1lQ5D525 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syce1lQ5D525 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syce1lQ5D525 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syce1lQ5D525 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syce1lQ5D525 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syce1lQ5D525 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syce1lQ5D525 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syce1lQ5D525 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syce1lQ5D525 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syce1lQ5D525 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syce1lQ5D525 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syce1lQ5D525 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syce1lQ5D525 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syce1lQ5D525 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syce1lQ5D525 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syce1lQ5D525 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syce1lQ5D525 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syce1lQ5D525 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms