Protein–RNA interactions for Protein: Q59J78

Ndufaf2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf2Q59J78 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ndufaf2Q59J78 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ndufaf2Q59J78 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ndufaf2Q59J78 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ndufaf2Q59J78 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ndufaf2Q59J78 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ndufaf2Q59J78 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ndufaf2Q59J78 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ndufaf2Q59J78 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ndufaf2Q59J78 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ndufaf2Q59J78 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ndufaf2Q59J78 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ndufaf2Q59J78 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ndufaf2Q59J78 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Ndufaf2Q59J78 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ndufaf2Q59J78 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ndufaf2Q59J78 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ndufaf2Q59J78 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ndufaf2Q59J78 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ndufaf2Q59J78 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ndufaf2Q59J78 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Ndufaf2Q59J78 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ndufaf2Q59J78 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Ndufaf2Q59J78 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ndufaf2Q59J78 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ndufaf2Q59J78 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ndufaf2Q59J78 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ndufaf2Q59J78 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Ndufaf2Q59J78 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ndufaf2Q59J78 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ndufaf2Q59J78 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Ndufaf2Q59J78 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ndufaf2Q59J78 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ndufaf2Q59J78 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ndufaf2Q59J78 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ndufaf2Q59J78 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ndufaf2Q59J78 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ndufaf2Q59J78 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ndufaf2Q59J78 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ndufaf2Q59J78 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ndufaf2Q59J78 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ndufaf2Q59J78 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ndufaf2Q59J78 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ndufaf2Q59J78 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ndufaf2Q59J78 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Ndufaf2Q59J78 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ndufaf2Q59J78 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ndufaf2Q59J78 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ndufaf2Q59J78 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ndufaf2Q59J78 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ndufaf2Q59J78 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ndufaf2Q59J78 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ndufaf2Q59J78 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ndufaf2Q59J78 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ndufaf2Q59J78 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ndufaf2Q59J78 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ndufaf2Q59J78 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ndufaf2Q59J78 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ndufaf2Q59J78 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ndufaf2Q59J78 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ndufaf2Q59J78 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ndufaf2Q59J78 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ndufaf2Q59J78 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ndufaf2Q59J78 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ndufaf2Q59J78 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Ndufaf2Q59J78 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ndufaf2Q59J78 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ndufaf2Q59J78 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ndufaf2Q59J78 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ndufaf2Q59J78 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ndufaf2Q59J78 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ndufaf2Q59J78 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ndufaf2Q59J78 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ndufaf2Q59J78 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ndufaf2Q59J78 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ndufaf2Q59J78 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ndufaf2Q59J78 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ndufaf2Q59J78 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ndufaf2Q59J78 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ndufaf2Q59J78 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Ndufaf2Q59J78 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ndufaf2Q59J78 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ndufaf2Q59J78 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ndufaf2Q59J78 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ndufaf2Q59J78 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ndufaf2Q59J78 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ndufaf2Q59J78 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ndufaf2Q59J78 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ndufaf2Q59J78 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ndufaf2Q59J78 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ndufaf2Q59J78 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ndufaf2Q59J78 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ndufaf2Q59J78 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ndufaf2Q59J78 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ndufaf2Q59J78 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ndufaf2Q59J78 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ndufaf2Q59J78 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ndufaf2Q59J78 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ndufaf2Q59J78 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ndufaf2Q59J78 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms