Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJM7

Otol1, Otolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otol1Q4ZJM7 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Otol1Q4ZJM7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Otol1Q4ZJM7 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Otol1Q4ZJM7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Otol1Q4ZJM7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Otol1Q4ZJM7 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Otol1Q4ZJM7 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Otol1Q4ZJM7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Otol1Q4ZJM7 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Otol1Q4ZJM7 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Otol1Q4ZJM7 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Otol1Q4ZJM7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Otol1Q4ZJM7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Otol1Q4ZJM7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Otol1Q4ZJM7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
Otol1Q4ZJM7 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Otol1Q4ZJM7 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Otol1Q4ZJM7 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Otol1Q4ZJM7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Otol1Q4ZJM7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Otol1Q4ZJM7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Otol1Q4ZJM7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Otol1Q4ZJM7 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Otol1Q4ZJM7 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Otol1Q4ZJM7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Otol1Q4ZJM7 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Otol1Q4ZJM7 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Otol1Q4ZJM7 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Otol1Q4ZJM7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Otol1Q4ZJM7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Otol1Q4ZJM7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Otol1Q4ZJM7 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Otol1Q4ZJM7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Otol1Q4ZJM7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Otol1Q4ZJM7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Otol1Q4ZJM7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Otol1Q4ZJM7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Otol1Q4ZJM7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Otol1Q4ZJM7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Otol1Q4ZJM7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Otol1Q4ZJM7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Otol1Q4ZJM7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Otol1Q4ZJM7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Otol1Q4ZJM7 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Otol1Q4ZJM7 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Otol1Q4ZJM7 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Otol1Q4ZJM7 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Otol1Q4ZJM7 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Otol1Q4ZJM7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Otol1Q4ZJM7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Otol1Q4ZJM7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Otol1Q4ZJM7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Otol1Q4ZJM7 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Otol1Q4ZJM7 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Otol1Q4ZJM7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Otol1Q4ZJM7 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Otol1Q4ZJM7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Otol1Q4ZJM7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Otol1Q4ZJM7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Otol1Q4ZJM7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Otol1Q4ZJM7 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Otol1Q4ZJM7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Otol1Q4ZJM7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Otol1Q4ZJM7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Otol1Q4ZJM7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Otol1Q4ZJM7 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Otol1Q4ZJM7 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Otol1Q4ZJM7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Otol1Q4ZJM7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Otol1Q4ZJM7 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Otol1Q4ZJM7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Otol1Q4ZJM7 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Otol1Q4ZJM7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Otol1Q4ZJM7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Otol1Q4ZJM7 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Otol1Q4ZJM7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Otol1Q4ZJM7 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Otol1Q4ZJM7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Otol1Q4ZJM7 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Otol1Q4ZJM7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Otol1Q4ZJM7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Otol1Q4ZJM7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Otol1Q4ZJM7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Otol1Q4ZJM7 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Otol1Q4ZJM7 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Otol1Q4ZJM7 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Otol1Q4ZJM7 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Otol1Q4ZJM7 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Otol1Q4ZJM7 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Otol1Q4ZJM7 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Otol1Q4ZJM7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Otol1Q4ZJM7 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Otol1Q4ZJM7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Otol1Q4ZJM7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Otol1Q4ZJM7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Otol1Q4ZJM7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Otol1Q4ZJM7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Otol1Q4ZJM7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Otol1Q4ZJM7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Otol1Q4ZJM7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms