Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trappc3lQ4KL14 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trappc3lQ4KL14 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trappc3lQ4KL14 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trappc3lQ4KL14 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trappc3lQ4KL14 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trappc3lQ4KL14 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trappc3lQ4KL14 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trappc3lQ4KL14 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trappc3lQ4KL14 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trappc3lQ4KL14 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trappc3lQ4KL14 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trappc3lQ4KL14 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trappc3lQ4KL14 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trappc3lQ4KL14 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trappc3lQ4KL14 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trappc3lQ4KL14 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Trappc3lQ4KL14 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Trappc3lQ4KL14 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trappc3lQ4KL14 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trappc3lQ4KL14 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Trappc3lQ4KL14 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trappc3lQ4KL14 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trappc3lQ4KL14 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trappc3lQ4KL14 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trappc3lQ4KL14 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trappc3lQ4KL14 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trappc3lQ4KL14 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trappc3lQ4KL14 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trappc3lQ4KL14 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trappc3lQ4KL14 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trappc3lQ4KL14 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trappc3lQ4KL14 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trappc3lQ4KL14 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trappc3lQ4KL14 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trappc3lQ4KL14 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trappc3lQ4KL14 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trappc3lQ4KL14 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trappc3lQ4KL14 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trappc3lQ4KL14 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trappc3lQ4KL14 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trappc3lQ4KL14 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trappc3lQ4KL14 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trappc3lQ4KL14 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Trappc3lQ4KL14 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trappc3lQ4KL14 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trappc3lQ4KL14 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trappc3lQ4KL14 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trappc3lQ4KL14 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trappc3lQ4KL14 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trappc3lQ4KL14 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trappc3lQ4KL14 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trappc3lQ4KL14 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trappc3lQ4KL14 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trappc3lQ4KL14 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trappc3lQ4KL14 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trappc3lQ4KL14 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trappc3lQ4KL14 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trappc3lQ4KL14 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trappc3lQ4KL14 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trappc3lQ4KL14 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trappc3lQ4KL14 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trappc3lQ4KL14 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trappc3lQ4KL14 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trappc3lQ4KL14 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trappc3lQ4KL14 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trappc3lQ4KL14 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trappc3lQ4KL14 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trappc3lQ4KL14 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trappc3lQ4KL14 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trappc3lQ4KL14 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trappc3lQ4KL14 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trappc3lQ4KL14 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trappc3lQ4KL14 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trappc3lQ4KL14 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trappc3lQ4KL14 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trappc3lQ4KL14 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trappc3lQ4KL14 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trappc3lQ4KL14 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trappc3lQ4KL14 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trappc3lQ4KL14 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Trappc3lQ4KL14 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trappc3lQ4KL14 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trappc3lQ4KL14 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trappc3lQ4KL14 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trappc3lQ4KL14 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trappc3lQ4KL14 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trappc3lQ4KL14 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trappc3lQ4KL14 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trappc3lQ4KL14 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trappc3lQ4KL14 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trappc3lQ4KL14 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trappc3lQ4KL14 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trappc3lQ4KL14 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Trappc3lQ4KL14 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trappc3lQ4KL14 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trappc3lQ4KL14 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trappc3lQ4KL14 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trappc3lQ4KL14 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trappc3lQ4KL14 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms