Protein–RNA interactions for Protein: Q497I4

Krt35, Keratin, type I cuticular Ha5, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt35Q497I4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt35Q497I4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt35Q497I4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt35Q497I4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt35Q497I4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt35Q497I4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt35Q497I4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt35Q497I4 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt35Q497I4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt35Q497I4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt35Q497I4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Krt35Q497I4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Krt35Q497I4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Krt35Q497I4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Krt35Q497I4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Krt35Q497I4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Krt35Q497I4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Krt35Q497I4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Krt35Q497I4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Krt35Q497I4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt35Q497I4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt35Q497I4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt35Q497I4 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt35Q497I4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt35Q497I4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt35Q497I4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt35Q497I4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt35Q497I4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt35Q497I4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt35Q497I4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt35Q497I4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt35Q497I4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt35Q497I4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt35Q497I4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krt35Q497I4 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krt35Q497I4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krt35Q497I4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krt35Q497I4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Krt35Q497I4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krt35Q497I4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krt35Q497I4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krt35Q497I4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krt35Q497I4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krt35Q497I4 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krt35Q497I4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krt35Q497I4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krt35Q497I4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krt35Q497I4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krt35Q497I4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Krt35Q497I4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Krt35Q497I4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Krt35Q497I4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Krt35Q497I4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Krt35Q497I4 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Krt35Q497I4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Krt35Q497I4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Krt35Q497I4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Krt35Q497I4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Krt35Q497I4 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Krt35Q497I4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Krt35Q497I4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Krt35Q497I4 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Krt35Q497I4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt35Q497I4 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt35Q497I4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt35Q497I4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt35Q497I4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt35Q497I4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt35Q497I4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt35Q497I4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt35Q497I4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt35Q497I4 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt35Q497I4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt35Q497I4 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt35Q497I4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt35Q497I4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt35Q497I4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt35Q497I4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt35Q497I4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt35Q497I4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt35Q497I4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt35Q497I4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt35Q497I4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt35Q497I4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt35Q497I4 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt35Q497I4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt35Q497I4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt35Q497I4 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt35Q497I4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt35Q497I4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt35Q497I4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt35Q497I4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt35Q497I4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt35Q497I4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt35Q497I4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt35Q497I4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt35Q497I4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt35Q497I4 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt35Q497I4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt35Q497I4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms