Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H9

Samd5, Sterile alpha motif domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd5Q3V1H9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Samd5Q3V1H9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Samd5Q3V1H9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Samd5Q3V1H9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Samd5Q3V1H9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Samd5Q3V1H9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Samd5Q3V1H9 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Samd5Q3V1H9 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Samd5Q3V1H9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Samd5Q3V1H9 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Samd5Q3V1H9 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Samd5Q3V1H9 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Samd5Q3V1H9 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Samd5Q3V1H9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Samd5Q3V1H9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Samd5Q3V1H9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Samd5Q3V1H9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Samd5Q3V1H9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Samd5Q3V1H9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Samd5Q3V1H9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Samd5Q3V1H9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Samd5Q3V1H9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Samd5Q3V1H9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Samd5Q3V1H9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Samd5Q3V1H9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Samd5Q3V1H9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Samd5Q3V1H9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Samd5Q3V1H9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Samd5Q3V1H9 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Samd5Q3V1H9 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Samd5Q3V1H9 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Samd5Q3V1H9 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Samd5Q3V1H9 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Samd5Q3V1H9 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Samd5Q3V1H9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Samd5Q3V1H9 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Samd5Q3V1H9 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Samd5Q3V1H9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Samd5Q3V1H9 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Samd5Q3V1H9 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Samd5Q3V1H9 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Samd5Q3V1H9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd5Q3V1H9 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd5Q3V1H9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd5Q3V1H9 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd5Q3V1H9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd5Q3V1H9 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd5Q3V1H9 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd5Q3V1H9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd5Q3V1H9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd5Q3V1H9 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd5Q3V1H9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd5Q3V1H9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd5Q3V1H9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd5Q3V1H9 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd5Q3V1H9 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd5Q3V1H9 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd5Q3V1H9 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd5Q3V1H9 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd5Q3V1H9 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd5Q3V1H9 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd5Q3V1H9 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd5Q3V1H9 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd5Q3V1H9 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd5Q3V1H9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd5Q3V1H9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd5Q3V1H9 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd5Q3V1H9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd5Q3V1H9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd5Q3V1H9 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd5Q3V1H9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Samd5Q3V1H9 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Samd5Q3V1H9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Samd5Q3V1H9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Samd5Q3V1H9 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Samd5Q3V1H9 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Samd5Q3V1H9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Samd5Q3V1H9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Samd5Q3V1H9 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Samd5Q3V1H9 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Samd5Q3V1H9 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Samd5Q3V1H9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Samd5Q3V1H9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Samd5Q3V1H9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Samd5Q3V1H9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Samd5Q3V1H9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Samd5Q3V1H9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Samd5Q3V1H9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Samd5Q3V1H9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samd5Q3V1H9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samd5Q3V1H9 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samd5Q3V1H9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samd5Q3V1H9 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samd5Q3V1H9 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samd5Q3V1H9 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samd5Q3V1H9 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samd5Q3V1H9 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samd5Q3V1H9 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samd5Q3V1H9 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samd5Q3V1H9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms