Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0G7

Garnl3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garnl3Q3V0G7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Garnl3Q3V0G7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Garnl3Q3V0G7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Garnl3Q3V0G7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Garnl3Q3V0G7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Garnl3Q3V0G7 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Garnl3Q3V0G7 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Garnl3Q3V0G7 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Garnl3Q3V0G7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Garnl3Q3V0G7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Garnl3Q3V0G7 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Garnl3Q3V0G7 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Garnl3Q3V0G7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Garnl3Q3V0G7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Garnl3Q3V0G7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Garnl3Q3V0G7 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Garnl3Q3V0G7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Garnl3Q3V0G7 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Garnl3Q3V0G7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Garnl3Q3V0G7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Garnl3Q3V0G7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Garnl3Q3V0G7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Garnl3Q3V0G7 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Garnl3Q3V0G7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Garnl3Q3V0G7 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Garnl3Q3V0G7 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Garnl3Q3V0G7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Garnl3Q3V0G7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Garnl3Q3V0G7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Garnl3Q3V0G7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Garnl3Q3V0G7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Garnl3Q3V0G7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Garnl3Q3V0G7 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Garnl3Q3V0G7 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Garnl3Q3V0G7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Garnl3Q3V0G7 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Garnl3Q3V0G7 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Garnl3Q3V0G7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Garnl3Q3V0G7 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Garnl3Q3V0G7 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Garnl3Q3V0G7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Garnl3Q3V0G7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Garnl3Q3V0G7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Garnl3Q3V0G7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Garnl3Q3V0G7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Garnl3Q3V0G7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Garnl3Q3V0G7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Garnl3Q3V0G7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Garnl3Q3V0G7 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Garnl3Q3V0G7 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Garnl3Q3V0G7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Garnl3Q3V0G7 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Garnl3Q3V0G7 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Garnl3Q3V0G7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Garnl3Q3V0G7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Garnl3Q3V0G7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Garnl3Q3V0G7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Garnl3Q3V0G7 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Garnl3Q3V0G7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Garnl3Q3V0G7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Garnl3Q3V0G7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Garnl3Q3V0G7 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Garnl3Q3V0G7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Garnl3Q3V0G7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Garnl3Q3V0G7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Garnl3Q3V0G7 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Garnl3Q3V0G7 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Garnl3Q3V0G7 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Garnl3Q3V0G7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Garnl3Q3V0G7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Garnl3Q3V0G7 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Garnl3Q3V0G7 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Garnl3Q3V0G7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Garnl3Q3V0G7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Garnl3Q3V0G7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Garnl3Q3V0G7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Garnl3Q3V0G7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Garnl3Q3V0G7 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Garnl3Q3V0G7 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Garnl3Q3V0G7 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Garnl3Q3V0G7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Garnl3Q3V0G7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Garnl3Q3V0G7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Garnl3Q3V0G7 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Garnl3Q3V0G7 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Garnl3Q3V0G7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Garnl3Q3V0G7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Garnl3Q3V0G7 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Garnl3Q3V0G7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Garnl3Q3V0G7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Garnl3Q3V0G7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Garnl3Q3V0G7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Garnl3Q3V0G7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Garnl3Q3V0G7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Garnl3Q3V0G7 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Garnl3Q3V0G7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Garnl3Q3V0G7 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Garnl3Q3V0G7 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Garnl3Q3V0G7 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Garnl3Q3V0G7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms