Protein–RNA interactions for Protein: Q3UY51

Lrrc55, Leucine-rich repeat-containing protein 55, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc55Q3UY51 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrc55Q3UY51 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrc55Q3UY51 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrc55Q3UY51 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrc55Q3UY51 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrc55Q3UY51 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrc55Q3UY51 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrc55Q3UY51 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrc55Q3UY51 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrc55Q3UY51 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrc55Q3UY51 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrc55Q3UY51 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrc55Q3UY51 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrc55Q3UY51 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrc55Q3UY51 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrc55Q3UY51 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrc55Q3UY51 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrc55Q3UY51 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrc55Q3UY51 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrc55Q3UY51 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrc55Q3UY51 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrc55Q3UY51 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrc55Q3UY51 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrc55Q3UY51 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrc55Q3UY51 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrc55Q3UY51 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrc55Q3UY51 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrc55Q3UY51 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrc55Q3UY51 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrc55Q3UY51 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrc55Q3UY51 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrc55Q3UY51 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrc55Q3UY51 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrc55Q3UY51 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrc55Q3UY51 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrc55Q3UY51 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrc55Q3UY51 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrc55Q3UY51 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrc55Q3UY51 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrc55Q3UY51 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrc55Q3UY51 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrc55Q3UY51 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Lrrc55Q3UY51 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrc55Q3UY51 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrc55Q3UY51 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrc55Q3UY51 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrc55Q3UY51 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrc55Q3UY51 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrc55Q3UY51 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrc55Q3UY51 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrc55Q3UY51 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrc55Q3UY51 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrc55Q3UY51 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrc55Q3UY51 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrc55Q3UY51 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrc55Q3UY51 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrc55Q3UY51 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrc55Q3UY51 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrc55Q3UY51 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrc55Q3UY51 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrc55Q3UY51 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrc55Q3UY51 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrc55Q3UY51 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrc55Q3UY51 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrc55Q3UY51 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrc55Q3UY51 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrc55Q3UY51 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrc55Q3UY51 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrc55Q3UY51 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrc55Q3UY51 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrc55Q3UY51 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrc55Q3UY51 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrc55Q3UY51 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrc55Q3UY51 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrc55Q3UY51 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrc55Q3UY51 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrc55Q3UY51 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrc55Q3UY51 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrc55Q3UY51 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrc55Q3UY51 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrc55Q3UY51 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrc55Q3UY51 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrc55Q3UY51 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrc55Q3UY51 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrc55Q3UY51 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrc55Q3UY51 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrc55Q3UY51 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrc55Q3UY51 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrc55Q3UY51 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrc55Q3UY51 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrc55Q3UY51 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrc55Q3UY51 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrc55Q3UY51 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrc55Q3UY51 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrc55Q3UY51 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrc55Q3UY51 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrc55Q3UY51 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrc55Q3UY51 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrc55Q3UY51 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrc55Q3UY51 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms