Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWL8

Pfdn4, Prefoldin subunit 4, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn4Q3UWL8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pfdn4Q3UWL8 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pfdn4Q3UWL8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pfdn4Q3UWL8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pfdn4Q3UWL8 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pfdn4Q3UWL8 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pfdn4Q3UWL8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pfdn4Q3UWL8 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pfdn4Q3UWL8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pfdn4Q3UWL8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Pfdn4Q3UWL8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pfdn4Q3UWL8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pfdn4Q3UWL8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pfdn4Q3UWL8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pfdn4Q3UWL8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Pfdn4Q3UWL8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pfdn4Q3UWL8 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pfdn4Q3UWL8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pfdn4Q3UWL8 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pfdn4Q3UWL8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pfdn4Q3UWL8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pfdn4Q3UWL8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pfdn4Q3UWL8 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pfdn4Q3UWL8 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pfdn4Q3UWL8 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pfdn4Q3UWL8 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pfdn4Q3UWL8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pfdn4Q3UWL8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pfdn4Q3UWL8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pfdn4Q3UWL8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pfdn4Q3UWL8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pfdn4Q3UWL8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pfdn4Q3UWL8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pfdn4Q3UWL8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Pfdn4Q3UWL8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pfdn4Q3UWL8 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pfdn4Q3UWL8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Pfdn4Q3UWL8 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pfdn4Q3UWL8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pfdn4Q3UWL8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pfdn4Q3UWL8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pfdn4Q3UWL8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pfdn4Q3UWL8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pfdn4Q3UWL8 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pfdn4Q3UWL8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pfdn4Q3UWL8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Pfdn4Q3UWL8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pfdn4Q3UWL8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pfdn4Q3UWL8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pfdn4Q3UWL8 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pfdn4Q3UWL8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pfdn4Q3UWL8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pfdn4Q3UWL8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pfdn4Q3UWL8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pfdn4Q3UWL8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pfdn4Q3UWL8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Pfdn4Q3UWL8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pfdn4Q3UWL8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pfdn4Q3UWL8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pfdn4Q3UWL8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pfdn4Q3UWL8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pfdn4Q3UWL8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pfdn4Q3UWL8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pfdn4Q3UWL8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Pfdn4Q3UWL8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pfdn4Q3UWL8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pfdn4Q3UWL8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pfdn4Q3UWL8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pfdn4Q3UWL8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pfdn4Q3UWL8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pfdn4Q3UWL8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Pfdn4Q3UWL8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pfdn4Q3UWL8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pfdn4Q3UWL8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pfdn4Q3UWL8 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pfdn4Q3UWL8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pfdn4Q3UWL8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pfdn4Q3UWL8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pfdn4Q3UWL8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pfdn4Q3UWL8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pfdn4Q3UWL8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pfdn4Q3UWL8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pfdn4Q3UWL8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pfdn4Q3UWL8 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pfdn4Q3UWL8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pfdn4Q3UWL8 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Pfdn4Q3UWL8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pfdn4Q3UWL8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pfdn4Q3UWL8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pfdn4Q3UWL8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pfdn4Q3UWL8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Pfdn4Q3UWL8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pfdn4Q3UWL8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pfdn4Q3UWL8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pfdn4Q3UWL8 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pfdn4Q3UWL8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pfdn4Q3UWL8 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pfdn4Q3UWL8 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pfdn4Q3UWL8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pfdn4Q3UWL8 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
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