Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW98

Clca4b, Chloride channel accessory 4B, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca4bQ3UW98 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Clca4bQ3UW98 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clca4bQ3UW98 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clca4bQ3UW98 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clca4bQ3UW98 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clca4bQ3UW98 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clca4bQ3UW98 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clca4bQ3UW98 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clca4bQ3UW98 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clca4bQ3UW98 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clca4bQ3UW98 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clca4bQ3UW98 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clca4bQ3UW98 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clca4bQ3UW98 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clca4bQ3UW98 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clca4bQ3UW98 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clca4bQ3UW98 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clca4bQ3UW98 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clca4bQ3UW98 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clca4bQ3UW98 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clca4bQ3UW98 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clca4bQ3UW98 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clca4bQ3UW98 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Clca4bQ3UW98 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clca4bQ3UW98 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Clca4bQ3UW98 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Clca4bQ3UW98 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clca4bQ3UW98 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Clca4bQ3UW98 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clca4bQ3UW98 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clca4bQ3UW98 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clca4bQ3UW98 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clca4bQ3UW98 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clca4bQ3UW98 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clca4bQ3UW98 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clca4bQ3UW98 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clca4bQ3UW98 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Clca4bQ3UW98 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clca4bQ3UW98 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Clca4bQ3UW98 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clca4bQ3UW98 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clca4bQ3UW98 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clca4bQ3UW98 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clca4bQ3UW98 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clca4bQ3UW98 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clca4bQ3UW98 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clca4bQ3UW98 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clca4bQ3UW98 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clca4bQ3UW98 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Clca4bQ3UW98 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clca4bQ3UW98 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clca4bQ3UW98 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clca4bQ3UW98 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clca4bQ3UW98 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clca4bQ3UW98 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Clca4bQ3UW98 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clca4bQ3UW98 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clca4bQ3UW98 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clca4bQ3UW98 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clca4bQ3UW98 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clca4bQ3UW98 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clca4bQ3UW98 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clca4bQ3UW98 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clca4bQ3UW98 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clca4bQ3UW98 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clca4bQ3UW98 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clca4bQ3UW98 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clca4bQ3UW98 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clca4bQ3UW98 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clca4bQ3UW98 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clca4bQ3UW98 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Clca4bQ3UW98 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clca4bQ3UW98 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clca4bQ3UW98 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clca4bQ3UW98 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clca4bQ3UW98 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clca4bQ3UW98 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clca4bQ3UW98 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clca4bQ3UW98 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Clca4bQ3UW98 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clca4bQ3UW98 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clca4bQ3UW98 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clca4bQ3UW98 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clca4bQ3UW98 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clca4bQ3UW98 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clca4bQ3UW98 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clca4bQ3UW98 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clca4bQ3UW98 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clca4bQ3UW98 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clca4bQ3UW98 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clca4bQ3UW98 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clca4bQ3UW98 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clca4bQ3UW98 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clca4bQ3UW98 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clca4bQ3UW98 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clca4bQ3UW98 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clca4bQ3UW98 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clca4bQ3UW98 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clca4bQ3UW98 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clca4bQ3UW98 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms