Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV66

Slfn4, Schlafen 4, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn4Q3UV66 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Slfn4Q3UV66 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Slfn4Q3UV66 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Slfn4Q3UV66 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Slfn4Q3UV66 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Slfn4Q3UV66 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Slfn4Q3UV66 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Slfn4Q3UV66 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Slfn4Q3UV66 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Slfn4Q3UV66 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Slfn4Q3UV66 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Slfn4Q3UV66 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Slfn4Q3UV66 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Slfn4Q3UV66 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Slfn4Q3UV66 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Slfn4Q3UV66 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Slfn4Q3UV66 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Slfn4Q3UV66 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Slfn4Q3UV66 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Slfn4Q3UV66 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Slfn4Q3UV66 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Slfn4Q3UV66 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Slfn4Q3UV66 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Slfn4Q3UV66 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Slfn4Q3UV66 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Slfn4Q3UV66 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Slfn4Q3UV66 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Slfn4Q3UV66 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Slfn4Q3UV66 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Slfn4Q3UV66 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Slfn4Q3UV66 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Slfn4Q3UV66 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Slfn4Q3UV66 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Slfn4Q3UV66 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Slfn4Q3UV66 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Slfn4Q3UV66 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Slfn4Q3UV66 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Slfn4Q3UV66 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Slfn4Q3UV66 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Slfn4Q3UV66 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Slfn4Q3UV66 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Slfn4Q3UV66 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Slfn4Q3UV66 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Slfn4Q3UV66 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Slfn4Q3UV66 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Slfn4Q3UV66 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Slfn4Q3UV66 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Slfn4Q3UV66 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Slfn4Q3UV66 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Slfn4Q3UV66 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Slfn4Q3UV66 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Slfn4Q3UV66 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Slfn4Q3UV66 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Slfn4Q3UV66 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Slfn4Q3UV66 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Slfn4Q3UV66 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Slfn4Q3UV66 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Slfn4Q3UV66 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Slfn4Q3UV66 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Slfn4Q3UV66 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Slfn4Q3UV66 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Slfn4Q3UV66 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Slfn4Q3UV66 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Slfn4Q3UV66 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Slfn4Q3UV66 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Slfn4Q3UV66 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Slfn4Q3UV66 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Slfn4Q3UV66 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slfn4Q3UV66 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slfn4Q3UV66 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slfn4Q3UV66 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slfn4Q3UV66 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slfn4Q3UV66 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slfn4Q3UV66 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slfn4Q3UV66 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slfn4Q3UV66 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slfn4Q3UV66 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slfn4Q3UV66 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slfn4Q3UV66 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Slfn4Q3UV66 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Slfn4Q3UV66 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Slfn4Q3UV66 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Slfn4Q3UV66 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Slfn4Q3UV66 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Slfn4Q3UV66 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Slfn4Q3UV66 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Slfn4Q3UV66 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Slfn4Q3UV66 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Slfn4Q3UV66 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Slfn4Q3UV66 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Slfn4Q3UV66 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slfn4Q3UV66 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slfn4Q3UV66 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slfn4Q3UV66 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slfn4Q3UV66 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slfn4Q3UV66 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slfn4Q3UV66 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slfn4Q3UV66 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slfn4Q3UV66 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slfn4Q3UV66 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms