Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV55

Nr1d1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1d1Q3UV55 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nr1d1Q3UV55 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Nr1d1Q3UV55 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nr1d1Q3UV55 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nr1d1Q3UV55 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Nr1d1Q3UV55 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nr1d1Q3UV55 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nr1d1Q3UV55 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nr1d1Q3UV55 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nr1d1Q3UV55 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nr1d1Q3UV55 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Nr1d1Q3UV55 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nr1d1Q3UV55 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nr1d1Q3UV55 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nr1d1Q3UV55 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nr1d1Q3UV55 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nr1d1Q3UV55 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nr1d1Q3UV55 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Nr1d1Q3UV55 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nr1d1Q3UV55 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nr1d1Q3UV55 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nr1d1Q3UV55 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nr1d1Q3UV55 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nr1d1Q3UV55 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Nr1d1Q3UV55 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Nr1d1Q3UV55 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Nr1d1Q3UV55 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Nr1d1Q3UV55 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nr1d1Q3UV55 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nr1d1Q3UV55 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nr1d1Q3UV55 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nr1d1Q3UV55 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Nr1d1Q3UV55 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nr1d1Q3UV55 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nr1d1Q3UV55 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nr1d1Q3UV55 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nr1d1Q3UV55 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nr1d1Q3UV55 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nr1d1Q3UV55 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nr1d1Q3UV55 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nr1d1Q3UV55 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nr1d1Q3UV55 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Nr1d1Q3UV55 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nr1d1Q3UV55 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nr1d1Q3UV55 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nr1d1Q3UV55 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nr1d1Q3UV55 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nr1d1Q3UV55 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nr1d1Q3UV55 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nr1d1Q3UV55 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nr1d1Q3UV55 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nr1d1Q3UV55 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nr1d1Q3UV55 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nr1d1Q3UV55 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nr1d1Q3UV55 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nr1d1Q3UV55 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nr1d1Q3UV55 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nr1d1Q3UV55 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Nr1d1Q3UV55 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nr1d1Q3UV55 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Nr1d1Q3UV55 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nr1d1Q3UV55 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nr1d1Q3UV55 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nr1d1Q3UV55 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nr1d1Q3UV55 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nr1d1Q3UV55 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nr1d1Q3UV55 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nr1d1Q3UV55 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nr1d1Q3UV55 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nr1d1Q3UV55 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nr1d1Q3UV55 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nr1d1Q3UV55 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nr1d1Q3UV55 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nr1d1Q3UV55 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nr1d1Q3UV55 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nr1d1Q3UV55 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nr1d1Q3UV55 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nr1d1Q3UV55 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nr1d1Q3UV55 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nr1d1Q3UV55 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nr1d1Q3UV55 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Nr1d1Q3UV55 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nr1d1Q3UV55 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nr1d1Q3UV55 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nr1d1Q3UV55 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Nr1d1Q3UV55 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nr1d1Q3UV55 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nr1d1Q3UV55 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nr1d1Q3UV55 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nr1d1Q3UV55 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Nr1d1Q3UV55 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nr1d1Q3UV55 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Nr1d1Q3UV55 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nr1d1Q3UV55 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nr1d1Q3UV55 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nr1d1Q3UV55 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nr1d1Q3UV55 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Nr1d1Q3UV55 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nr1d1Q3UV55 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nr1d1Q3UV55 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms