Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU96

Cdc42bpa, Serine/threonine-protein kinase MRCK alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42bpaQ3UU96 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cdc42bpaQ3UU96 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cdc42bpaQ3UU96 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cdc42bpaQ3UU96 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Cdc42bpaQ3UU96 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cdc42bpaQ3UU96 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cdc42bpaQ3UU96 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Cdc42bpaQ3UU96 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cdc42bpaQ3UU96 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cdc42bpaQ3UU96 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cdc42bpaQ3UU96 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cdc42bpaQ3UU96 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cdc42bpaQ3UU96 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cdc42bpaQ3UU96 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cdc42bpaQ3UU96 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Cdc42bpaQ3UU96 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cdc42bpaQ3UU96 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cdc42bpaQ3UU96 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cdc42bpaQ3UU96 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cdc42bpaQ3UU96 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cdc42bpaQ3UU96 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cdc42bpaQ3UU96 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cdc42bpaQ3UU96 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cdc42bpaQ3UU96 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cdc42bpaQ3UU96 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cdc42bpaQ3UU96 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cdc42bpaQ3UU96 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cdc42bpaQ3UU96 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cdc42bpaQ3UU96 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cdc42bpaQ3UU96 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cdc42bpaQ3UU96 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cdc42bpaQ3UU96 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cdc42bpaQ3UU96 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cdc42bpaQ3UU96 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cdc42bpaQ3UU96 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cdc42bpaQ3UU96 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cdc42bpaQ3UU96 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cdc42bpaQ3UU96 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Cdc42bpaQ3UU96 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cdc42bpaQ3UU96 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cdc42bpaQ3UU96 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cdc42bpaQ3UU96 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cdc42bpaQ3UU96 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cdc42bpaQ3UU96 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cdc42bpaQ3UU96 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cdc42bpaQ3UU96 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cdc42bpaQ3UU96 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cdc42bpaQ3UU96 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cdc42bpaQ3UU96 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cdc42bpaQ3UU96 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
Cdc42bpaQ3UU96 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cdc42bpaQ3UU96 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cdc42bpaQ3UU96 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cdc42bpaQ3UU96 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cdc42bpaQ3UU96 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cdc42bpaQ3UU96 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cdc42bpaQ3UU96 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cdc42bpaQ3UU96 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cdc42bpaQ3UU96 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cdc42bpaQ3UU96 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cdc42bpaQ3UU96 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cdc42bpaQ3UU96 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cdc42bpaQ3UU96 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cdc42bpaQ3UU96 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cdc42bpaQ3UU96 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cdc42bpaQ3UU96 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cdc42bpaQ3UU96 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cdc42bpaQ3UU96 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cdc42bpaQ3UU96 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cdc42bpaQ3UU96 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cdc42bpaQ3UU96 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cdc42bpaQ3UU96 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cdc42bpaQ3UU96 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cdc42bpaQ3UU96 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Cdc42bpaQ3UU96 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cdc42bpaQ3UU96 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cdc42bpaQ3UU96 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cdc42bpaQ3UU96 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Cdc42bpaQ3UU96 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cdc42bpaQ3UU96 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cdc42bpaQ3UU96 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cdc42bpaQ3UU96 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cdc42bpaQ3UU96 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cdc42bpaQ3UU96 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cdc42bpaQ3UU96 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cdc42bpaQ3UU96 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cdc42bpaQ3UU96 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cdc42bpaQ3UU96 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cdc42bpaQ3UU96 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Cdc42bpaQ3UU96 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Cdc42bpaQ3UU96 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cdc42bpaQ3UU96 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cdc42bpaQ3UU96 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cdc42bpaQ3UU96 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cdc42bpaQ3UU96 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cdc42bpaQ3UU96 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cdc42bpaQ3UU96 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cdc42bpaQ3UU96 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cdc42bpaQ3UU96 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cdc42bpaQ3UU96 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms