Protein–RNA interactions for Protein: Q3USJ8

Fchsd2, F-BAR and double SH3 domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fchsd2Q3USJ8 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fchsd2Q3USJ8 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Fchsd2Q3USJ8 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fchsd2Q3USJ8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Fchsd2Q3USJ8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fchsd2Q3USJ8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fchsd2Q3USJ8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fchsd2Q3USJ8 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fchsd2Q3USJ8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fchsd2Q3USJ8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fchsd2Q3USJ8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Fchsd2Q3USJ8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fchsd2Q3USJ8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fchsd2Q3USJ8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Fchsd2Q3USJ8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fchsd2Q3USJ8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fchsd2Q3USJ8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fchsd2Q3USJ8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fchsd2Q3USJ8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fchsd2Q3USJ8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fchsd2Q3USJ8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fchsd2Q3USJ8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fchsd2Q3USJ8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fchsd2Q3USJ8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fchsd2Q3USJ8 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Fchsd2Q3USJ8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fchsd2Q3USJ8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fchsd2Q3USJ8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Fchsd2Q3USJ8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fchsd2Q3USJ8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fchsd2Q3USJ8 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fchsd2Q3USJ8 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fchsd2Q3USJ8 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fchsd2Q3USJ8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fchsd2Q3USJ8 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fchsd2Q3USJ8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fchsd2Q3USJ8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fchsd2Q3USJ8 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fchsd2Q3USJ8 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fchsd2Q3USJ8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fchsd2Q3USJ8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fchsd2Q3USJ8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fchsd2Q3USJ8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fchsd2Q3USJ8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fchsd2Q3USJ8 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fchsd2Q3USJ8 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fchsd2Q3USJ8 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fchsd2Q3USJ8 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Fchsd2Q3USJ8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Fchsd2Q3USJ8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fchsd2Q3USJ8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fchsd2Q3USJ8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fchsd2Q3USJ8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fchsd2Q3USJ8 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fchsd2Q3USJ8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fchsd2Q3USJ8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Fchsd2Q3USJ8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fchsd2Q3USJ8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Fchsd2Q3USJ8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fchsd2Q3USJ8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fchsd2Q3USJ8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fchsd2Q3USJ8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fchsd2Q3USJ8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Fchsd2Q3USJ8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fchsd2Q3USJ8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fchsd2Q3USJ8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Fchsd2Q3USJ8 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fchsd2Q3USJ8 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Fchsd2Q3USJ8 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fchsd2Q3USJ8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Fchsd2Q3USJ8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fchsd2Q3USJ8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fchsd2Q3USJ8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fchsd2Q3USJ8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fchsd2Q3USJ8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fchsd2Q3USJ8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fchsd2Q3USJ8 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fchsd2Q3USJ8 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fchsd2Q3USJ8 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fchsd2Q3USJ8 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fchsd2Q3USJ8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fchsd2Q3USJ8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fchsd2Q3USJ8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fchsd2Q3USJ8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fchsd2Q3USJ8 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fchsd2Q3USJ8 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fchsd2Q3USJ8 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fchsd2Q3USJ8 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fchsd2Q3USJ8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fchsd2Q3USJ8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fchsd2Q3USJ8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fchsd2Q3USJ8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fchsd2Q3USJ8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fchsd2Q3USJ8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fchsd2Q3USJ8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fchsd2Q3USJ8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fchsd2Q3USJ8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fchsd2Q3USJ8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fchsd2Q3USJ8 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Fchsd2Q3USJ8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms