Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf48Q3US17 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf48Q3US17 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf48Q3US17 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf48Q3US17 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf48Q3US17 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf48Q3US17 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf48Q3US17 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf48Q3US17 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf48Q3US17 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf48Q3US17 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf48Q3US17 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf48Q3US17 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf48Q3US17 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf48Q3US17 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf48Q3US17 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf48Q3US17 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf48Q3US17 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf48Q3US17 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Znf48Q3US17 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Znf48Q3US17 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Znf48Q3US17 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Znf48Q3US17 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Znf48Q3US17 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Znf48Q3US17 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Znf48Q3US17 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Znf48Q3US17 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Znf48Q3US17 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Znf48Q3US17 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Znf48Q3US17 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Znf48Q3US17 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Znf48Q3US17 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Znf48Q3US17 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Znf48Q3US17 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Znf48Q3US17 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Znf48Q3US17 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Znf48Q3US17 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Znf48Q3US17 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Znf48Q3US17 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Znf48Q3US17 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Znf48Q3US17 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Znf48Q3US17 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Znf48Q3US17 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Znf48Q3US17 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Znf48Q3US17 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
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Znf48Q3US17 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Znf48Q3US17 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Znf48Q3US17 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Znf48Q3US17 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Znf48Q3US17 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Znf48Q3US17 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Znf48Q3US17 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Znf48Q3US17 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Znf48Q3US17 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Znf48Q3US17 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Znf48Q3US17 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Znf48Q3US17 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Znf48Q3US17 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Znf48Q3US17 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Znf48Q3US17 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Znf48Q3US17 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Znf48Q3US17 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Znf48Q3US17 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Znf48Q3US17 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Znf48Q3US17 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Znf48Q3US17 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Znf48Q3US17 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Znf48Q3US17 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Znf48Q3US17 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Znf48Q3US17 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Znf48Q3US17 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Znf48Q3US17 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Znf48Q3US17 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Znf48Q3US17 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Znf48Q3US17 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Znf48Q3US17 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Znf48Q3US17 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Znf48Q3US17 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Znf48Q3US17 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Znf48Q3US17 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Znf48Q3US17 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Znf48Q3US17 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Znf48Q3US17 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Znf48Q3US17 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Znf48Q3US17 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Znf48Q3US17 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Znf48Q3US17 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Znf48Q3US17 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Znf48Q3US17 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Znf48Q3US17 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Znf48Q3US17 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Znf48Q3US17 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Znf48Q3US17 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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