Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMW8

Cln5, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 5 homolog, mousemouse

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Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln5Q3UMW8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cln5Q3UMW8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cln5Q3UMW8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cln5Q3UMW8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cln5Q3UMW8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cln5Q3UMW8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cln5Q3UMW8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cln5Q3UMW8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cln5Q3UMW8 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cln5Q3UMW8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cln5Q3UMW8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cln5Q3UMW8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cln5Q3UMW8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cln5Q3UMW8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cln5Q3UMW8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cln5Q3UMW8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cln5Q3UMW8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cln5Q3UMW8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cln5Q3UMW8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cln5Q3UMW8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cln5Q3UMW8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cln5Q3UMW8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cln5Q3UMW8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cln5Q3UMW8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cln5Q3UMW8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cln5Q3UMW8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cln5Q3UMW8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cln5Q3UMW8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cln5Q3UMW8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cln5Q3UMW8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cln5Q3UMW8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cln5Q3UMW8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cln5Q3UMW8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cln5Q3UMW8 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cln5Q3UMW8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cln5Q3UMW8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cln5Q3UMW8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cln5Q3UMW8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cln5Q3UMW8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cln5Q3UMW8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cln5Q3UMW8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cln5Q3UMW8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cln5Q3UMW8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cln5Q3UMW8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cln5Q3UMW8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cln5Q3UMW8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cln5Q3UMW8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cln5Q3UMW8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cln5Q3UMW8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cln5Q3UMW8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cln5Q3UMW8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cln5Q3UMW8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cln5Q3UMW8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cln5Q3UMW8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cln5Q3UMW8 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cln5Q3UMW8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cln5Q3UMW8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cln5Q3UMW8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cln5Q3UMW8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cln5Q3UMW8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cln5Q3UMW8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cln5Q3UMW8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cln5Q3UMW8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cln5Q3UMW8 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cln5Q3UMW8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cln5Q3UMW8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cln5Q3UMW8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cln5Q3UMW8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cln5Q3UMW8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cln5Q3UMW8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cln5Q3UMW8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cln5Q3UMW8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cln5Q3UMW8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cln5Q3UMW8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cln5Q3UMW8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cln5Q3UMW8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cln5Q3UMW8 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cln5Q3UMW8 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cln5Q3UMW8 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cln5Q3UMW8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cln5Q3UMW8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cln5Q3UMW8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cln5Q3UMW8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cln5Q3UMW8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cln5Q3UMW8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cln5Q3UMW8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cln5Q3UMW8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cln5Q3UMW8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cln5Q3UMW8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cln5Q3UMW8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cln5Q3UMW8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cln5Q3UMW8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cln5Q3UMW8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cln5Q3UMW8 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cln5Q3UMW8 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cln5Q3UMW8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cln5Q3UMW8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cln5Q3UMW8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cln5Q3UMW8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cln5Q3UMW8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms