Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULQ2

Pin1rt1, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pin1rt1Q3ULQ2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pin1rt1Q3ULQ2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pin1rt1Q3ULQ2 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pin1rt1Q3ULQ2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pin1rt1Q3ULQ2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pin1rt1Q3ULQ2 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pin1rt1Q3ULQ2 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pin1rt1Q3ULQ2 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pin1rt1Q3ULQ2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pin1rt1Q3ULQ2 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pin1rt1Q3ULQ2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pin1rt1Q3ULQ2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pin1rt1Q3ULQ2 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pin1rt1Q3ULQ2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pin1rt1Q3ULQ2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pin1rt1Q3ULQ2 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pin1rt1Q3ULQ2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pin1rt1Q3ULQ2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pin1rt1Q3ULQ2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pin1rt1Q3ULQ2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pin1rt1Q3ULQ2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pin1rt1Q3ULQ2 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pin1rt1Q3ULQ2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pin1rt1Q3ULQ2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pin1rt1Q3ULQ2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pin1rt1Q3ULQ2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pin1rt1Q3ULQ2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pin1rt1Q3ULQ2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pin1rt1Q3ULQ2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pin1rt1Q3ULQ2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pin1rt1Q3ULQ2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Pin1rt1Q3ULQ2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pin1rt1Q3ULQ2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms