Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULQ2

Pin1rt1, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pin1rt1Q3ULQ2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pin1rt1Q3ULQ2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pin1rt1Q3ULQ2 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pin1rt1Q3ULQ2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pin1rt1Q3ULQ2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pin1rt1Q3ULQ2 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pin1rt1Q3ULQ2 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pin1rt1Q3ULQ2 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pin1rt1Q3ULQ2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pin1rt1Q3ULQ2 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pin1rt1Q3ULQ2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pin1rt1Q3ULQ2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pin1rt1Q3ULQ2 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pin1rt1Q3ULQ2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pin1rt1Q3ULQ2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pin1rt1Q3ULQ2 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pin1rt1Q3ULQ2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pin1rt1Q3ULQ2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pin1rt1Q3ULQ2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pin1rt1Q3ULQ2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pin1rt1Q3ULQ2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pin1rt1Q3ULQ2 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pin1rt1Q3ULQ2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pin1rt1Q3ULQ2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pin1rt1Q3ULQ2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pin1rt1Q3ULQ2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pin1rt1Q3ULQ2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pin1rt1Q3ULQ2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pin1rt1Q3ULQ2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pin1rt1Q3ULQ2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pin1rt1Q3ULQ2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Pin1rt1Q3ULQ2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pin1rt1Q3ULQ2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pin1rt1Q3ULQ2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 775.3 ms