Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJP5

Protein C8orf37 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UJP5 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q3UJP5 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q3UJP5 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q3UJP5 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q3UJP5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q3UJP5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q3UJP5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Q3UJP5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q3UJP5 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q3UJP5 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q3UJP5 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q3UJP5 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q3UJP5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q3UJP5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q3UJP5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q3UJP5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q3UJP5 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q3UJP5 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q3UJP5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q3UJP5 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q3UJP5 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q3UJP5 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q3UJP5 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q3UJP5 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q3UJP5 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q3UJP5 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q3UJP5 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q3UJP5 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q3UJP5 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q3UJP5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q3UJP5 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q3UJP5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q3UJP5 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q3UJP5 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q3UJP5 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q3UJP5 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q3UJP5 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q3UJP5 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q3UJP5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q3UJP5 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q3UJP5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q3UJP5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q3UJP5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q3UJP5 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q3UJP5 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q3UJP5 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q3UJP5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q3UJP5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q3UJP5 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Q3UJP5 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q3UJP5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Q3UJP5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q3UJP5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q3UJP5 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q3UJP5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q3UJP5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q3UJP5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q3UJP5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Q3UJP5 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Q3UJP5 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Q3UJP5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Q3UJP5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Q3UJP5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Q3UJP5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q3UJP5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q3UJP5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q3UJP5 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q3UJP5 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Q3UJP5 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q3UJP5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q3UJP5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q3UJP5 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q3UJP5 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Q3UJP5 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q3UJP5 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q3UJP5 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q3UJP5 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Q3UJP5 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q3UJP5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Q3UJP5 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q3UJP5 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q3UJP5 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q3UJP5 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q3UJP5 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q3UJP5 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q3UJP5 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q3UJP5 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Q3UJP5 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q3UJP5 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q3UJP5 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Q3UJP5 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q3UJP5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q3UJP5 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q3UJP5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q3UJP5 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q3UJP5 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q3UJP5 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q3UJP5 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q3UJP5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q3UJP5 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms