Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sf3b2Q3UJB0 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sf3b2Q3UJB0 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sf3b2Q3UJB0 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sf3b2Q3UJB0 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sf3b2Q3UJB0 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sf3b2Q3UJB0 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sf3b2Q3UJB0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sf3b2Q3UJB0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sf3b2Q3UJB0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sf3b2Q3UJB0 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sf3b2Q3UJB0 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Sf3b2Q3UJB0 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sf3b2Q3UJB0 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sf3b2Q3UJB0 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sf3b2Q3UJB0 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sf3b2Q3UJB0 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sf3b2Q3UJB0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sf3b2Q3UJB0 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sf3b2Q3UJB0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sf3b2Q3UJB0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sf3b2Q3UJB0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sf3b2Q3UJB0 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Sf3b2Q3UJB0 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Sf3b2Q3UJB0 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sf3b2Q3UJB0 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sf3b2Q3UJB0 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sf3b2Q3UJB0 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sf3b2Q3UJB0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sf3b2Q3UJB0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sf3b2Q3UJB0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sf3b2Q3UJB0 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Sf3b2Q3UJB0 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sf3b2Q3UJB0 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Sf3b2Q3UJB0 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sf3b2Q3UJB0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sf3b2Q3UJB0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sf3b2Q3UJB0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sf3b2Q3UJB0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sf3b2Q3UJB0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sf3b2Q3UJB0 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Sf3b2Q3UJB0 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sf3b2Q3UJB0 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Sf3b2Q3UJB0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sf3b2Q3UJB0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sf3b2Q3UJB0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sf3b2Q3UJB0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sf3b2Q3UJB0 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Sf3b2Q3UJB0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sf3b2Q3UJB0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sf3b2Q3UJB0 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Sf3b2Q3UJB0 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sf3b2Q3UJB0 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sf3b2Q3UJB0 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sf3b2Q3UJB0 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sf3b2Q3UJB0 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sf3b2Q3UJB0 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sf3b2Q3UJB0 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sf3b2Q3UJB0 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sf3b2Q3UJB0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sf3b2Q3UJB0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sf3b2Q3UJB0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sf3b2Q3UJB0 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sf3b2Q3UJB0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sf3b2Q3UJB0 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sf3b2Q3UJB0 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sf3b2Q3UJB0 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sf3b2Q3UJB0 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sf3b2Q3UJB0 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sf3b2Q3UJB0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sf3b2Q3UJB0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sf3b2Q3UJB0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sf3b2Q3UJB0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sf3b2Q3UJB0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sf3b2Q3UJB0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Sf3b2Q3UJB0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sf3b2Q3UJB0 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sf3b2Q3UJB0 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sf3b2Q3UJB0 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sf3b2Q3UJB0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sf3b2Q3UJB0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sf3b2Q3UJB0 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sf3b2Q3UJB0 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Sf3b2Q3UJB0 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Sf3b2Q3UJB0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sf3b2Q3UJB0 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sf3b2Q3UJB0 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sf3b2Q3UJB0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sf3b2Q3UJB0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sf3b2Q3UJB0 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sf3b2Q3UJB0 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sf3b2Q3UJB0 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sf3b2Q3UJB0 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sf3b2Q3UJB0 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sf3b2Q3UJB0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sf3b2Q3UJB0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sf3b2Q3UJB0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sf3b2Q3UJB0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sf3b2Q3UJB0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sf3b2Q3UJB0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms