Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ81

Cnep1r1, Nuclear envelope phosphatase-regulatory subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnep1r1Q3UJ81 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnep1r1Q3UJ81 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnep1r1Q3UJ81 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnep1r1Q3UJ81 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnep1r1Q3UJ81 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnep1r1Q3UJ81 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnep1r1Q3UJ81 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnep1r1Q3UJ81 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnep1r1Q3UJ81 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnep1r1Q3UJ81 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnep1r1Q3UJ81 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnep1r1Q3UJ81 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnep1r1Q3UJ81 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnep1r1Q3UJ81 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnep1r1Q3UJ81 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnep1r1Q3UJ81 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnep1r1Q3UJ81 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnep1r1Q3UJ81 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnep1r1Q3UJ81 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnep1r1Q3UJ81 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnep1r1Q3UJ81 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnep1r1Q3UJ81 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnep1r1Q3UJ81 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnep1r1Q3UJ81 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnep1r1Q3UJ81 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnep1r1Q3UJ81 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnep1r1Q3UJ81 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnep1r1Q3UJ81 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnep1r1Q3UJ81 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnep1r1Q3UJ81 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnep1r1Q3UJ81 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnep1r1Q3UJ81 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnep1r1Q3UJ81 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnep1r1Q3UJ81 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnep1r1Q3UJ81 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnep1r1Q3UJ81 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnep1r1Q3UJ81 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnep1r1Q3UJ81 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnep1r1Q3UJ81 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cnep1r1Q3UJ81 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cnep1r1Q3UJ81 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cnep1r1Q3UJ81 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Cnep1r1Q3UJ81 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cnep1r1Q3UJ81 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cnep1r1Q3UJ81 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cnep1r1Q3UJ81 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cnep1r1Q3UJ81 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cnep1r1Q3UJ81 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cnep1r1Q3UJ81 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cnep1r1Q3UJ81 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cnep1r1Q3UJ81 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cnep1r1Q3UJ81 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cnep1r1Q3UJ81 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cnep1r1Q3UJ81 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Cnep1r1Q3UJ81 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Cnep1r1Q3UJ81 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cnep1r1Q3UJ81 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cnep1r1Q3UJ81 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cnep1r1Q3UJ81 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cnep1r1Q3UJ81 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cnep1r1Q3UJ81 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cnep1r1Q3UJ81 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Cnep1r1Q3UJ81 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cnep1r1Q3UJ81 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cnep1r1Q3UJ81 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cnep1r1Q3UJ81 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cnep1r1Q3UJ81 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cnep1r1Q3UJ81 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cnep1r1Q3UJ81 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cnep1r1Q3UJ81 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cnep1r1Q3UJ81 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cnep1r1Q3UJ81 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cnep1r1Q3UJ81 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Cnep1r1Q3UJ81 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cnep1r1Q3UJ81 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Cnep1r1Q3UJ81 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cnep1r1Q3UJ81 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cnep1r1Q3UJ81 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cnep1r1Q3UJ81 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cnep1r1Q3UJ81 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cnep1r1Q3UJ81 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cnep1r1Q3UJ81 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cnep1r1Q3UJ81 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cnep1r1Q3UJ81 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cnep1r1Q3UJ81 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cnep1r1Q3UJ81 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cnep1r1Q3UJ81 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cnep1r1Q3UJ81 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cnep1r1Q3UJ81 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cnep1r1Q3UJ81 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cnep1r1Q3UJ81 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Cnep1r1Q3UJ81 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cnep1r1Q3UJ81 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cnep1r1Q3UJ81 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cnep1r1Q3UJ81 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cnep1r1Q3UJ81 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cnep1r1Q3UJ81 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cnep1r1Q3UJ81 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cnep1r1Q3UJ81 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cnep1r1Q3UJ81 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms