Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHE1

Pitpnm3, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 974 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitpnm3Q3UHE1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pitpnm3Q3UHE1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pitpnm3Q3UHE1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pitpnm3Q3UHE1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pitpnm3Q3UHE1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pitpnm3Q3UHE1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Pitpnm3Q3UHE1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pitpnm3Q3UHE1 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pitpnm3Q3UHE1 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pitpnm3Q3UHE1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pitpnm3Q3UHE1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pitpnm3Q3UHE1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pitpnm3Q3UHE1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pitpnm3Q3UHE1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pitpnm3Q3UHE1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pitpnm3Q3UHE1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pitpnm3Q3UHE1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pitpnm3Q3UHE1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pitpnm3Q3UHE1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pitpnm3Q3UHE1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Pitpnm3Q3UHE1 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pitpnm3Q3UHE1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pitpnm3Q3UHE1 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pitpnm3Q3UHE1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pitpnm3Q3UHE1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pitpnm3Q3UHE1 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pitpnm3Q3UHE1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Pitpnm3Q3UHE1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pitpnm3Q3UHE1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pitpnm3Q3UHE1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pitpnm3Q3UHE1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pitpnm3Q3UHE1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pitpnm3Q3UHE1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pitpnm3Q3UHE1 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pitpnm3Q3UHE1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pitpnm3Q3UHE1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pitpnm3Q3UHE1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pitpnm3Q3UHE1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pitpnm3Q3UHE1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pitpnm3Q3UHE1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pitpnm3Q3UHE1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pitpnm3Q3UHE1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pitpnm3Q3UHE1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pitpnm3Q3UHE1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pitpnm3Q3UHE1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pitpnm3Q3UHE1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pitpnm3Q3UHE1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pitpnm3Q3UHE1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pitpnm3Q3UHE1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pitpnm3Q3UHE1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pitpnm3Q3UHE1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Pitpnm3Q3UHE1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pitpnm3Q3UHE1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pitpnm3Q3UHE1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pitpnm3Q3UHE1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pitpnm3Q3UHE1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pitpnm3Q3UHE1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pitpnm3Q3UHE1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pitpnm3Q3UHE1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pitpnm3Q3UHE1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pitpnm3Q3UHE1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pitpnm3Q3UHE1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pitpnm3Q3UHE1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pitpnm3Q3UHE1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pitpnm3Q3UHE1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pitpnm3Q3UHE1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pitpnm3Q3UHE1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pitpnm3Q3UHE1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pitpnm3Q3UHE1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Pitpnm3Q3UHE1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pitpnm3Q3UHE1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pitpnm3Q3UHE1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pitpnm3Q3UHE1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pitpnm3Q3UHE1 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pitpnm3Q3UHE1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pitpnm3Q3UHE1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pitpnm3Q3UHE1 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pitpnm3Q3UHE1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pitpnm3Q3UHE1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pitpnm3Q3UHE1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pitpnm3Q3UHE1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Pitpnm3Q3UHE1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pitpnm3Q3UHE1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pitpnm3Q3UHE1 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pitpnm3Q3UHE1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pitpnm3Q3UHE1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pitpnm3Q3UHE1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pitpnm3Q3UHE1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pitpnm3Q3UHE1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pitpnm3Q3UHE1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pitpnm3Q3UHE1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pitpnm3Q3UHE1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pitpnm3Q3UHE1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Pitpnm3Q3UHE1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Pitpnm3Q3UHE1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pitpnm3Q3UHE1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pitpnm3Q3UHE1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pitpnm3Q3UHE1 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pitpnm3Q3UHE1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pitpnm3Q3UHE1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms