Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHB8

Ccdc177, Coiled-coil domain-containing protein 177, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc177Q3UHB8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc177Q3UHB8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc177Q3UHB8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc177Q3UHB8 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc177Q3UHB8 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc177Q3UHB8 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc177Q3UHB8 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms