Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHB8

Ccdc177, Coiled-coil domain-containing protein 177, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc177Q3UHB8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc177Q3UHB8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc177Q3UHB8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc177Q3UHB8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc177Q3UHB8 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc177Q3UHB8 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc177Q3UHB8 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc177Q3UHB8 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms