Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gtpbp6Q3U6U5 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gtpbp6Q3U6U5 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Gm21156-201ENSMUST00000189693 869 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Gtpbp6Q3U6U5 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Gtpbp6Q3U6U5 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gtpbp6Q3U6U5 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gtpbp6Q3U6U5 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gtpbp6Q3U6U5 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gtpbp6Q3U6U5 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gtpbp6Q3U6U5 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gtpbp6Q3U6U5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gtpbp6Q3U6U5 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gtpbp6Q3U6U5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gtpbp6Q3U6U5 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gtpbp6Q3U6U5 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gtpbp6Q3U6U5 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gtpbp6Q3U6U5 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gtpbp6Q3U6U5 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gtpbp6Q3U6U5 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gtpbp6Q3U6U5 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gtpbp6Q3U6U5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gtpbp6Q3U6U5 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gtpbp6Q3U6U5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gtpbp6Q3U6U5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtpbp6Q3U6U5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtpbp6Q3U6U5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtpbp6Q3U6U5 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtpbp6Q3U6U5 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtpbp6Q3U6U5 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtpbp6Q3U6U5 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtpbp6Q3U6U5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtpbp6Q3U6U5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gtpbp6Q3U6U5 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gtpbp6Q3U6U5 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gtpbp6Q3U6U5 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gtpbp6Q3U6U5 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gtpbp6Q3U6U5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gtpbp6Q3U6U5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gtpbp6Q3U6U5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gtpbp6Q3U6U5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gtpbp6Q3U6U5 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gtpbp6Q3U6U5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gtpbp6Q3U6U5 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gtpbp6Q3U6U5 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gtpbp6Q3U6U5 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gtpbp6Q3U6U5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gtpbp6Q3U6U5 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtpbp6Q3U6U5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtpbp6Q3U6U5 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtpbp6Q3U6U5 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtpbp6Q3U6U5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtpbp6Q3U6U5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtpbp6Q3U6U5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtpbp6Q3U6U5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Gtpbp6Q3U6U5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gtpbp6Q3U6U5 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gtpbp6Q3U6U5 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gtpbp6Q3U6U5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gtpbp6Q3U6U5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gtpbp6Q3U6U5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gtpbp6Q3U6U5 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gtpbp6Q3U6U5 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Gtpbp6Q3U6U5 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gtpbp6Q3U6U5 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gtpbp6Q3U6U5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gtpbp6Q3U6U5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gtpbp6Q3U6U5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Gtpbp6Q3U6U5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
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