Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

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Length 105 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
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Q3U595 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3U595 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3U595 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3U595 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3U595 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3U595 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3U595 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3U595 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3U595 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3U595 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3U595 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3U595 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3U595 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3U595 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3U595 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3U595 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3U595 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3U595 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3U595 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3U595 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3U595 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3U595 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3U595 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3U595 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3U595 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3U595 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3U595 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3U595 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3U595 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3U595 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3U595 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3U595 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3U595 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3U595 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3U595 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3U595 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3U595 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3U595 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3U595 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3U595 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3U595 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3U595 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3U595 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3U595 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3U595 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3U595 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3U595 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3U595 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3U595 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3U595 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3U595 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Q3U595 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Q3U595 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Q3U595 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3U595 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3U595 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3U595 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3U595 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3U595 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Q3U595 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Q3U595 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3U595 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3U595 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3U595 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3U595 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3U595 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3U595 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q3U595 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q3U595 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q3U595 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q3U595 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Q3U595 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q3U595 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q3U595 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q3U595 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q3U595 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q3U595 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q3U595 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q3U595 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q3U595 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q3U595 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q3U595 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q3U595 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q3U595 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q3U595 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q3U595 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q3U595 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q3U595 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q3U595 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q3U595 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms