Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssbp4Q3U4B1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssbp4Q3U4B1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssbp4Q3U4B1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssbp4Q3U4B1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssbp4Q3U4B1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssbp4Q3U4B1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssbp4Q3U4B1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssbp4Q3U4B1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssbp4Q3U4B1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssbp4Q3U4B1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssbp4Q3U4B1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssbp4Q3U4B1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssbp4Q3U4B1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssbp4Q3U4B1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssbp4Q3U4B1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssbp4Q3U4B1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssbp4Q3U4B1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssbp4Q3U4B1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssbp4Q3U4B1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssbp4Q3U4B1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssbp4Q3U4B1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssbp4Q3U4B1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssbp4Q3U4B1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssbp4Q3U4B1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssbp4Q3U4B1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssbp4Q3U4B1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssbp4Q3U4B1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssbp4Q3U4B1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssbp4Q3U4B1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssbp4Q3U4B1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssbp4Q3U4B1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssbp4Q3U4B1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssbp4Q3U4B1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssbp4Q3U4B1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssbp4Q3U4B1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssbp4Q3U4B1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssbp4Q3U4B1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssbp4Q3U4B1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssbp4Q3U4B1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssbp4Q3U4B1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssbp4Q3U4B1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssbp4Q3U4B1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssbp4Q3U4B1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssbp4Q3U4B1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssbp4Q3U4B1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssbp4Q3U4B1 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssbp4Q3U4B1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssbp4Q3U4B1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssbp4Q3U4B1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssbp4Q3U4B1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssbp4Q3U4B1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssbp4Q3U4B1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssbp4Q3U4B1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssbp4Q3U4B1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssbp4Q3U4B1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssbp4Q3U4B1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssbp4Q3U4B1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssbp4Q3U4B1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssbp4Q3U4B1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssbp4Q3U4B1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssbp4Q3U4B1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssbp4Q3U4B1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ssbp4Q3U4B1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ssbp4Q3U4B1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ssbp4Q3U4B1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ssbp4Q3U4B1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssbp4Q3U4B1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssbp4Q3U4B1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssbp4Q3U4B1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssbp4Q3U4B1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssbp4Q3U4B1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssbp4Q3U4B1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssbp4Q3U4B1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssbp4Q3U4B1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssbp4Q3U4B1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssbp4Q3U4B1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssbp4Q3U4B1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssbp4Q3U4B1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssbp4Q3U4B1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssbp4Q3U4B1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssbp4Q3U4B1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssbp4Q3U4B1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssbp4Q3U4B1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssbp4Q3U4B1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssbp4Q3U4B1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssbp4Q3U4B1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssbp4Q3U4B1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssbp4Q3U4B1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssbp4Q3U4B1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssbp4Q3U4B1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssbp4Q3U4B1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssbp4Q3U4B1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssbp4Q3U4B1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssbp4Q3U4B1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssbp4Q3U4B1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssbp4Q3U4B1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssbp4Q3U4B1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssbp4Q3U4B1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssbp4Q3U4B1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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