Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0A6

Hbq1b, Globin d1, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hbq1bQ3U0A6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hbq1bQ3U0A6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hbq1bQ3U0A6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hbq1bQ3U0A6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Hbq1bQ3U0A6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hbq1bQ3U0A6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hbq1bQ3U0A6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hbq1bQ3U0A6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
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Hbq1bQ3U0A6 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hbq1bQ3U0A6 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hbq1bQ3U0A6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hbq1bQ3U0A6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
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Hbq1bQ3U0A6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Hbq1bQ3U0A6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hbq1bQ3U0A6 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hbq1bQ3U0A6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hbq1bQ3U0A6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hbq1bQ3U0A6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hbq1bQ3U0A6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Hbq1bQ3U0A6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hbq1bQ3U0A6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Hbq1bQ3U0A6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Hbq1bQ3U0A6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Hbq1bQ3U0A6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hbq1bQ3U0A6 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hbq1bQ3U0A6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hbq1bQ3U0A6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
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Hbq1bQ3U0A6 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hbq1bQ3U0A6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
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Hbq1bQ3U0A6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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Hbq1bQ3U0A6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hbq1bQ3U0A6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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Hbq1bQ3U0A6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hbq1bQ3U0A6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hbq1bQ3U0A6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hbq1bQ3U0A6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hbq1bQ3U0A6 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hbq1bQ3U0A6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hbq1bQ3U0A6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hbq1bQ3U0A6 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hbq1bQ3U0A6 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hbq1bQ3U0A6 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hbq1bQ3U0A6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hbq1bQ3U0A6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hbq1bQ3U0A6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hbq1bQ3U0A6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hbq1bQ3U0A6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hbq1bQ3U0A6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hbq1bQ3U0A6 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
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Hbq1bQ3U0A6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms