Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWN3

Cnnm2, Metal transporter CNNM2, mousemouse

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm2Q3TWN3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnnm2Q3TWN3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnnm2Q3TWN3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnnm2Q3TWN3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnnm2Q3TWN3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnnm2Q3TWN3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnnm2Q3TWN3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnnm2Q3TWN3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnnm2Q3TWN3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnnm2Q3TWN3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnnm2Q3TWN3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnnm2Q3TWN3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnnm2Q3TWN3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnnm2Q3TWN3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnnm2Q3TWN3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnnm2Q3TWN3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnnm2Q3TWN3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnnm2Q3TWN3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cnnm2Q3TWN3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cnnm2Q3TWN3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cnnm2Q3TWN3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cnnm2Q3TWN3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cnnm2Q3TWN3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cnnm2Q3TWN3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cnnm2Q3TWN3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cnnm2Q3TWN3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cnnm2Q3TWN3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cnnm2Q3TWN3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cnnm2Q3TWN3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnnm2Q3TWN3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnnm2Q3TWN3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnnm2Q3TWN3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnnm2Q3TWN3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnnm2Q3TWN3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnnm2Q3TWN3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnnm2Q3TWN3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnnm2Q3TWN3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnnm2Q3TWN3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnnm2Q3TWN3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnnm2Q3TWN3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnnm2Q3TWN3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnnm2Q3TWN3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnnm2Q3TWN3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnnm2Q3TWN3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnnm2Q3TWN3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnnm2Q3TWN3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnnm2Q3TWN3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnnm2Q3TWN3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnnm2Q3TWN3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnnm2Q3TWN3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnnm2Q3TWN3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnnm2Q3TWN3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnnm2Q3TWN3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnnm2Q3TWN3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnnm2Q3TWN3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnnm2Q3TWN3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnnm2Q3TWN3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnnm2Q3TWN3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnnm2Q3TWN3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnnm2Q3TWN3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnnm2Q3TWN3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnnm2Q3TWN3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnnm2Q3TWN3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnnm2Q3TWN3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnnm2Q3TWN3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnnm2Q3TWN3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnnm2Q3TWN3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnnm2Q3TWN3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnnm2Q3TWN3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnnm2Q3TWN3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnnm2Q3TWN3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnnm2Q3TWN3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnnm2Q3TWN3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnnm2Q3TWN3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnnm2Q3TWN3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnnm2Q3TWN3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnnm2Q3TWN3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnnm2Q3TWN3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnnm2Q3TWN3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnnm2Q3TWN3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnnm2Q3TWN3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnnm2Q3TWN3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnnm2Q3TWN3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cnnm2Q3TWN3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cnnm2Q3TWN3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cnnm2Q3TWN3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cnnm2Q3TWN3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cnnm2Q3TWN3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cnnm2Q3TWN3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cnnm2Q3TWN3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cnnm2Q3TWN3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cnnm2Q3TWN3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cnnm2Q3TWN3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnnm2Q3TWN3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnnm2Q3TWN3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnnm2Q3TWN3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnnm2Q3TWN3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnnm2Q3TWN3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnnm2Q3TWN3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnnm2Q3TWN3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms