Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Ccdc136Q3TVA9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Ccdc136Q3TVA9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Ccdc136Q3TVA9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Ccdc136Q3TVA9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Ccdc136Q3TVA9 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
Ccdc136Q3TVA9 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Ccdc136Q3TVA9 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
Ccdc136Q3TVA9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Ccdc136Q3TVA9 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Ccdc136Q3TVA9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Ccdc136Q3TVA9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Ccdc136Q3TVA9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Ccdc136Q3TVA9 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Ccdc136Q3TVA9 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Ccdc136Q3TVA9 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Ccdc136Q3TVA9 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Ccdc136Q3TVA9 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Ccdc136Q3TVA9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Ccdc136Q3TVA9 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Ccdc136Q3TVA9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.97
Ccdc136Q3TVA9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Ccdc136Q3TVA9 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Ccdc136Q3TVA9 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Ccdc136Q3TVA9 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Ccdc136Q3TVA9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Ccdc136Q3TVA9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Ccdc136Q3TVA9 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Ccdc136Q3TVA9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Ccdc136Q3TVA9 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Ccdc136Q3TVA9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Ccdc136Q3TVA9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Ccdc136Q3TVA9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Ccdc136Q3TVA9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
Ccdc136Q3TVA9 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Ccdc136Q3TVA9 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Ccdc136Q3TVA9 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Ccdc136Q3TVA9 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Ccdc136Q3TVA9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Ccdc136Q3TVA9 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Ccdc136Q3TVA9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Ccdc136Q3TVA9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Ccdc136Q3TVA9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Ccdc136Q3TVA9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Ccdc136Q3TVA9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Ccdc136Q3TVA9 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
Ccdc136Q3TVA9 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Ccdc136Q3TVA9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Ccdc136Q3TVA9 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Ccdc136Q3TVA9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Ccdc136Q3TVA9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Ccdc136Q3TVA9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Ccdc136Q3TVA9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Ccdc136Q3TVA9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
Ccdc136Q3TVA9 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Ccdc136Q3TVA9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Ccdc136Q3TVA9 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Ccdc136Q3TVA9 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Ccdc136Q3TVA9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Ccdc136Q3TVA9 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Ccdc136Q3TVA9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Ccdc136Q3TVA9 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Ccdc136Q3TVA9 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Ccdc136Q3TVA9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Ccdc136Q3TVA9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Ccdc136Q3TVA9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Ccdc136Q3TVA9 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Ccdc136Q3TVA9 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Ccdc136Q3TVA9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
Ccdc136Q3TVA9 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Ccdc136Q3TVA9 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Ccdc136Q3TVA9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Ccdc136Q3TVA9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Ccdc136Q3TVA9 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Ccdc136Q3TVA9 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
Ccdc136Q3TVA9 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
Ccdc136Q3TVA9 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Ccdc136Q3TVA9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Ccdc136Q3TVA9 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Ccdc136Q3TVA9 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
Ccdc136Q3TVA9 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
Ccdc136Q3TVA9 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
Ccdc136Q3TVA9 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
Ccdc136Q3TVA9 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Ccdc136Q3TVA9 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Ccdc136Q3TVA9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Ccdc136Q3TVA9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Ccdc136Q3TVA9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Ccdc136Q3TVA9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Ccdc136Q3TVA9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Ccdc136Q3TVA9 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Ccdc136Q3TVA9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Ccdc136Q3TVA9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Ccdc136Q3TVA9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Ccdc136Q3TVA9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Ccdc136Q3TVA9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Ccdc136Q3TVA9 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Ccdc136Q3TVA9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Ccdc136Q3TVA9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Ccdc136Q3TVA9 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms