Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTD8

Gm21440, Predicted gene, 20737, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21440Q3TTD8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm21440Q3TTD8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm21440Q3TTD8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm21440Q3TTD8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm21440Q3TTD8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm21440Q3TTD8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm21440Q3TTD8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21440Q3TTD8 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21440Q3TTD8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21440Q3TTD8 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21440Q3TTD8 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21440Q3TTD8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21440Q3TTD8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21440Q3TTD8 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21440Q3TTD8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21440Q3TTD8 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21440Q3TTD8 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21440Q3TTD8 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21440Q3TTD8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21440Q3TTD8 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21440Q3TTD8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21440Q3TTD8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21440Q3TTD8 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21440Q3TTD8 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21440Q3TTD8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21440Q3TTD8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21440Q3TTD8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21440Q3TTD8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21440Q3TTD8 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21440Q3TTD8 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21440Q3TTD8 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21440Q3TTD8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21440Q3TTD8 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21440Q3TTD8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21440Q3TTD8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21440Q3TTD8 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21440Q3TTD8 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21440Q3TTD8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21440Q3TTD8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21440Q3TTD8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21440Q3TTD8 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21440Q3TTD8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21440Q3TTD8 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21440Q3TTD8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21440Q3TTD8 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21440Q3TTD8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21440Q3TTD8 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21440Q3TTD8 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21440Q3TTD8 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21440Q3TTD8 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21440Q3TTD8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21440Q3TTD8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21440Q3TTD8 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21440Q3TTD8 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21440Q3TTD8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21440Q3TTD8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21440Q3TTD8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21440Q3TTD8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21440Q3TTD8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21440Q3TTD8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21440Q3TTD8 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21440Q3TTD8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21440Q3TTD8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21440Q3TTD8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21440Q3TTD8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21440Q3TTD8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21440Q3TTD8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21440Q3TTD8 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21440Q3TTD8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21440Q3TTD8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21440Q3TTD8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21440Q3TTD8 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21440Q3TTD8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21440Q3TTD8 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21440Q3TTD8 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21440Q3TTD8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21440Q3TTD8 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21440Q3TTD8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21440Q3TTD8 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21440Q3TTD8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21440Q3TTD8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21440Q3TTD8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21440Q3TTD8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21440Q3TTD8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21440Q3TTD8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21440Q3TTD8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21440Q3TTD8 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21440Q3TTD8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21440Q3TTD8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21440Q3TTD8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21440Q3TTD8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21440Q3TTD8 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21440Q3TTD8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21440Q3TTD8 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21440Q3TTD8 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21440Q3TTD8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21440Q3TTD8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21440Q3TTD8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21440Q3TTD8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21440Q3TTD8 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms