Protein–RNA interactions for Protein: Q3TL44

Nlrx1, NLR family member X1, mousemouse

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Length 975 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrx1Q3TL44 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Nlrx1Q3TL44 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nlrx1Q3TL44 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nlrx1Q3TL44 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nlrx1Q3TL44 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nlrx1Q3TL44 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nlrx1Q3TL44 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nlrx1Q3TL44 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nlrx1Q3TL44 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nlrx1Q3TL44 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nlrx1Q3TL44 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nlrx1Q3TL44 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nlrx1Q3TL44 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nlrx1Q3TL44 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nlrx1Q3TL44 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nlrx1Q3TL44 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nlrx1Q3TL44 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nlrx1Q3TL44 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nlrx1Q3TL44 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nlrx1Q3TL44 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nlrx1Q3TL44 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nlrx1Q3TL44 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nlrx1Q3TL44 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nlrx1Q3TL44 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nlrx1Q3TL44 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nlrx1Q3TL44 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Nlrx1Q3TL44 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nlrx1Q3TL44 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nlrx1Q3TL44 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nlrx1Q3TL44 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nlrx1Q3TL44 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nlrx1Q3TL44 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nlrx1Q3TL44 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nlrx1Q3TL44 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Nlrx1Q3TL44 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nlrx1Q3TL44 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nlrx1Q3TL44 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nlrx1Q3TL44 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nlrx1Q3TL44 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nlrx1Q3TL44 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nlrx1Q3TL44 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nlrx1Q3TL44 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nlrx1Q3TL44 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nlrx1Q3TL44 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nlrx1Q3TL44 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nlrx1Q3TL44 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Nlrx1Q3TL44 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nlrx1Q3TL44 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nlrx1Q3TL44 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nlrx1Q3TL44 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Nlrx1Q3TL44 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nlrx1Q3TL44 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nlrx1Q3TL44 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nlrx1Q3TL44 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Nlrx1Q3TL44 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nlrx1Q3TL44 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nlrx1Q3TL44 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nlrx1Q3TL44 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nlrx1Q3TL44 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nlrx1Q3TL44 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nlrx1Q3TL44 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nlrx1Q3TL44 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nlrx1Q3TL44 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nlrx1Q3TL44 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nlrx1Q3TL44 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nlrx1Q3TL44 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nlrx1Q3TL44 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nlrx1Q3TL44 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Nlrx1Q3TL44 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nlrx1Q3TL44 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nlrx1Q3TL44 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nlrx1Q3TL44 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nlrx1Q3TL44 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nlrx1Q3TL44 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nlrx1Q3TL44 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nlrx1Q3TL44 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nlrx1Q3TL44 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nlrx1Q3TL44 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nlrx1Q3TL44 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nlrx1Q3TL44 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nlrx1Q3TL44 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nlrx1Q3TL44 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Nlrx1Q3TL44 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nlrx1Q3TL44 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nlrx1Q3TL44 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nlrx1Q3TL44 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nlrx1Q3TL44 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nlrx1Q3TL44 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nlrx1Q3TL44 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nlrx1Q3TL44 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nlrx1Q3TL44 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nlrx1Q3TL44 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nlrx1Q3TL44 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nlrx1Q3TL44 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nlrx1Q3TL44 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nlrx1Q3TL44 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nlrx1Q3TL44 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nlrx1Q3TL44 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nlrx1Q3TL44 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nlrx1Q3TL44 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms