Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKY6

Cwc27, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CWC27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc27Q3TKY6 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cwc27Q3TKY6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cwc27Q3TKY6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cwc27Q3TKY6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cwc27Q3TKY6 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Cwc27Q3TKY6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cwc27Q3TKY6 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cwc27Q3TKY6 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cwc27Q3TKY6 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Cwc27Q3TKY6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cwc27Q3TKY6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cwc27Q3TKY6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cwc27Q3TKY6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cwc27Q3TKY6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cwc27Q3TKY6 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cwc27Q3TKY6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cwc27Q3TKY6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Cwc27Q3TKY6 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cwc27Q3TKY6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cwc27Q3TKY6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cwc27Q3TKY6 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cwc27Q3TKY6 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Cwc27Q3TKY6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cwc27Q3TKY6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Cwc27Q3TKY6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cwc27Q3TKY6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cwc27Q3TKY6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cwc27Q3TKY6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cwc27Q3TKY6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cwc27Q3TKY6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cwc27Q3TKY6 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cwc27Q3TKY6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cwc27Q3TKY6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cwc27Q3TKY6 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Cwc27Q3TKY6 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cwc27Q3TKY6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cwc27Q3TKY6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cwc27Q3TKY6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cwc27Q3TKY6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cwc27Q3TKY6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cwc27Q3TKY6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cwc27Q3TKY6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cwc27Q3TKY6 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cwc27Q3TKY6 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cwc27Q3TKY6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cwc27Q3TKY6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Cwc27Q3TKY6 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cwc27Q3TKY6 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cwc27Q3TKY6 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Cwc27Q3TKY6 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cwc27Q3TKY6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cwc27Q3TKY6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cwc27Q3TKY6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cwc27Q3TKY6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cwc27Q3TKY6 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cwc27Q3TKY6 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cwc27Q3TKY6 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cwc27Q3TKY6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cwc27Q3TKY6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cwc27Q3TKY6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cwc27Q3TKY6 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Cwc27Q3TKY6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cwc27Q3TKY6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cwc27Q3TKY6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Cwc27Q3TKY6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cwc27Q3TKY6 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cwc27Q3TKY6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cwc27Q3TKY6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cwc27Q3TKY6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cwc27Q3TKY6 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cwc27Q3TKY6 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cwc27Q3TKY6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cwc27Q3TKY6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cwc27Q3TKY6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cwc27Q3TKY6 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cwc27Q3TKY6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Cwc27Q3TKY6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cwc27Q3TKY6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cwc27Q3TKY6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cwc27Q3TKY6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cwc27Q3TKY6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cwc27Q3TKY6 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Cwc27Q3TKY6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cwc27Q3TKY6 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cwc27Q3TKY6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cwc27Q3TKY6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cwc27Q3TKY6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Cwc27Q3TKY6 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cwc27Q3TKY6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cwc27Q3TKY6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cwc27Q3TKY6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cwc27Q3TKY6 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Cwc27Q3TKY6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cwc27Q3TKY6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cwc27Q3TKY6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cwc27Q3TKY6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cwc27Q3TKY6 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cwc27Q3TKY6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cwc27Q3TKY6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cwc27Q3TKY6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms