Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc13Q3TIR1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc13Q3TIR1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc13Q3TIR1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc13Q3TIR1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc13Q3TIR1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc13Q3TIR1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc13Q3TIR1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc13Q3TIR1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trappc13Q3TIR1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trappc13Q3TIR1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trappc13Q3TIR1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc13Q3TIR1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc13Q3TIR1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc13Q3TIR1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc13Q3TIR1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc13Q3TIR1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc13Q3TIR1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc13Q3TIR1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc13Q3TIR1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc13Q3TIR1 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc13Q3TIR1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc13Q3TIR1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc13Q3TIR1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc13Q3TIR1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc13Q3TIR1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc13Q3TIR1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc13Q3TIR1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc13Q3TIR1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc13Q3TIR1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc13Q3TIR1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc13Q3TIR1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc13Q3TIR1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc13Q3TIR1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc13Q3TIR1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc13Q3TIR1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc13Q3TIR1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc13Q3TIR1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc13Q3TIR1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc13Q3TIR1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc13Q3TIR1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc13Q3TIR1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc13Q3TIR1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc13Q3TIR1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc13Q3TIR1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc13Q3TIR1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc13Q3TIR1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc13Q3TIR1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc13Q3TIR1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc13Q3TIR1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc13Q3TIR1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc13Q3TIR1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc13Q3TIR1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc13Q3TIR1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc13Q3TIR1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc13Q3TIR1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc13Q3TIR1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc13Q3TIR1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc13Q3TIR1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc13Q3TIR1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc13Q3TIR1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc13Q3TIR1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc13Q3TIR1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc13Q3TIR1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc13Q3TIR1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc13Q3TIR1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc13Q3TIR1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc13Q3TIR1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc13Q3TIR1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc13Q3TIR1 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc13Q3TIR1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc13Q3TIR1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc13Q3TIR1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc13Q3TIR1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc13Q3TIR1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc13Q3TIR1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc13Q3TIR1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc13Q3TIR1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc13Q3TIR1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc13Q3TIR1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc13Q3TIR1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc13Q3TIR1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc13Q3TIR1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc13Q3TIR1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc13Q3TIR1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc13Q3TIR1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc13Q3TIR1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc13Q3TIR1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc13Q3TIR1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc13Q3TIR1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc13Q3TIR1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc13Q3TIR1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc13Q3TIR1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc13Q3TIR1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc13Q3TIR1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc13Q3TIR1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc13Q3TIR1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc13Q3TIR1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc13Q3TIR1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc13Q3TIR1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms