Protein–RNA interactions for Protein: Q3THK3

Gtf2f1, General transcription factor IIF subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2f1Q3THK3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Gtf2f1Q3THK3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gtf2f1Q3THK3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gtf2f1Q3THK3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtf2f1Q3THK3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtf2f1Q3THK3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtf2f1Q3THK3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtf2f1Q3THK3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtf2f1Q3THK3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtf2f1Q3THK3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtf2f1Q3THK3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtf2f1Q3THK3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtf2f1Q3THK3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtf2f1Q3THK3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtf2f1Q3THK3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtf2f1Q3THK3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtf2f1Q3THK3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtf2f1Q3THK3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtf2f1Q3THK3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtf2f1Q3THK3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtf2f1Q3THK3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtf2f1Q3THK3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtf2f1Q3THK3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtf2f1Q3THK3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtf2f1Q3THK3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtf2f1Q3THK3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtf2f1Q3THK3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtf2f1Q3THK3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtf2f1Q3THK3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtf2f1Q3THK3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtf2f1Q3THK3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtf2f1Q3THK3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtf2f1Q3THK3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtf2f1Q3THK3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtf2f1Q3THK3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtf2f1Q3THK3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Gtf2f1Q3THK3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gtf2f1Q3THK3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gtf2f1Q3THK3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Gtf2f1Q3THK3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gtf2f1Q3THK3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gtf2f1Q3THK3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gtf2f1Q3THK3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gtf2f1Q3THK3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Gtf2f1Q3THK3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gtf2f1Q3THK3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gtf2f1Q3THK3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gtf2f1Q3THK3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gtf2f1Q3THK3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gtf2f1Q3THK3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gtf2f1Q3THK3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gtf2f1Q3THK3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gtf2f1Q3THK3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gtf2f1Q3THK3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gtf2f1Q3THK3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gtf2f1Q3THK3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gtf2f1Q3THK3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gtf2f1Q3THK3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gtf2f1Q3THK3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gtf2f1Q3THK3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gtf2f1Q3THK3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gtf2f1Q3THK3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gtf2f1Q3THK3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gtf2f1Q3THK3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gtf2f1Q3THK3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gtf2f1Q3THK3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gtf2f1Q3THK3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gtf2f1Q3THK3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gtf2f1Q3THK3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gtf2f1Q3THK3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gtf2f1Q3THK3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gtf2f1Q3THK3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gtf2f1Q3THK3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gtf2f1Q3THK3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gtf2f1Q3THK3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gtf2f1Q3THK3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gtf2f1Q3THK3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gtf2f1Q3THK3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gtf2f1Q3THK3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gtf2f1Q3THK3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gtf2f1Q3THK3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Gtf2f1Q3THK3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gtf2f1Q3THK3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gtf2f1Q3THK3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Gtf2f1Q3THK3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gtf2f1Q3THK3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gtf2f1Q3THK3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Gtf2f1Q3THK3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gtf2f1Q3THK3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gtf2f1Q3THK3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gtf2f1Q3THK3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gtf2f1Q3THK3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gtf2f1Q3THK3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gtf2f1Q3THK3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtf2f1Q3THK3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtf2f1Q3THK3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtf2f1Q3THK3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtf2f1Q3THK3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtf2f1Q3THK3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtf2f1Q3THK3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms