Protein–RNA interactions for Protein: Q3TDV8

Zfp444, Zinc finger protein 444, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp444Q3TDV8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Zfp444Q3TDV8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Zfp444Q3TDV8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Zfp444Q3TDV8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Zfp444Q3TDV8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Zfp444Q3TDV8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Zfp444Q3TDV8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Zfp444Q3TDV8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Zfp444Q3TDV8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Zfp444Q3TDV8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Zfp444Q3TDV8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Zfp444Q3TDV8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Zfp444Q3TDV8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Zfp444Q3TDV8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Zfp444Q3TDV8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Zfp444Q3TDV8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Zfp444Q3TDV8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Zfp444Q3TDV8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Zfp444Q3TDV8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Zfp444Q3TDV8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Zfp444Q3TDV8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Zfp444Q3TDV8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Zfp444Q3TDV8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Zfp444Q3TDV8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Zfp444Q3TDV8 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Zfp444Q3TDV8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Zfp444Q3TDV8 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Zfp444Q3TDV8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Zfp444Q3TDV8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Zfp444Q3TDV8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Zfp444Q3TDV8 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Zfp444Q3TDV8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Zfp444Q3TDV8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Zfp444Q3TDV8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Zfp444Q3TDV8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Zfp444Q3TDV8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Zfp444Q3TDV8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Zfp444Q3TDV8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Zfp444Q3TDV8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Zfp444Q3TDV8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Zfp444Q3TDV8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Zfp444Q3TDV8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Zfp444Q3TDV8 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Zfp444Q3TDV8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Zfp444Q3TDV8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Zfp444Q3TDV8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Zfp444Q3TDV8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Zfp444Q3TDV8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Zfp444Q3TDV8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Zfp444Q3TDV8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Zfp444Q3TDV8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Zfp444Q3TDV8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Zfp444Q3TDV8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Zfp444Q3TDV8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Zfp444Q3TDV8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Zfp444Q3TDV8 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Zfp444Q3TDV8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Zfp444Q3TDV8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Zfp444Q3TDV8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Zfp444Q3TDV8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Zfp444Q3TDV8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Zfp444Q3TDV8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Zfp444Q3TDV8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Zfp444Q3TDV8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Zfp444Q3TDV8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Zfp444Q3TDV8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Zfp444Q3TDV8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Zfp444Q3TDV8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Zfp444Q3TDV8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Zfp444Q3TDV8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Zfp444Q3TDV8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Zfp444Q3TDV8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Zfp444Q3TDV8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Zfp444Q3TDV8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Zfp444Q3TDV8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Zfp444Q3TDV8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Zfp444Q3TDV8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Zfp444Q3TDV8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Zfp444Q3TDV8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Zfp444Q3TDV8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Zfp444Q3TDV8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Zfp444Q3TDV8 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Zfp444Q3TDV8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Zfp444Q3TDV8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Zfp444Q3TDV8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Zfp444Q3TDV8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Zfp444Q3TDV8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zfp444Q3TDV8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zfp444Q3TDV8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zfp444Q3TDV8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zfp444Q3TDV8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Zfp444Q3TDV8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zfp444Q3TDV8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zfp444Q3TDV8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zfp444Q3TDV8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zfp444Q3TDV8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zfp444Q3TDV8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Zfp444Q3TDV8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Zfp444Q3TDV8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Zfp444Q3TDV8 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms