Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prr27Q3SYJ2 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Prr27Q3SYJ2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Prr27Q3SYJ2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prr27Q3SYJ2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prr27Q3SYJ2 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prr27Q3SYJ2 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prr27Q3SYJ2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prr27Q3SYJ2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Prr27Q3SYJ2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prr27Q3SYJ2 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prr27Q3SYJ2 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prr27Q3SYJ2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prr27Q3SYJ2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prr27Q3SYJ2 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prr27Q3SYJ2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prr27Q3SYJ2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prr27Q3SYJ2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prr27Q3SYJ2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prr27Q3SYJ2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prr27Q3SYJ2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prr27Q3SYJ2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Prr27Q3SYJ2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prr27Q3SYJ2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prr27Q3SYJ2 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prr27Q3SYJ2 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prr27Q3SYJ2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Prr27Q3SYJ2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prr27Q3SYJ2 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prr27Q3SYJ2 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prr27Q3SYJ2 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prr27Q3SYJ2 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prr27Q3SYJ2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prr27Q3SYJ2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Prr27Q3SYJ2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Prr27Q3SYJ2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prr27Q3SYJ2 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prr27Q3SYJ2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prr27Q3SYJ2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prr27Q3SYJ2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prr27Q3SYJ2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prr27Q3SYJ2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prr27Q3SYJ2 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Prr27Q3SYJ2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prr27Q3SYJ2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prr27Q3SYJ2 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prr27Q3SYJ2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prr27Q3SYJ2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prr27Q3SYJ2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prr27Q3SYJ2 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prr27Q3SYJ2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prr27Q3SYJ2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prr27Q3SYJ2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prr27Q3SYJ2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prr27Q3SYJ2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prr27Q3SYJ2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prr27Q3SYJ2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prr27Q3SYJ2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prr27Q3SYJ2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prr27Q3SYJ2 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prr27Q3SYJ2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prr27Q3SYJ2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prr27Q3SYJ2 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prr27Q3SYJ2 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prr27Q3SYJ2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prr27Q3SYJ2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prr27Q3SYJ2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prr27Q3SYJ2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prr27Q3SYJ2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prr27Q3SYJ2 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prr27Q3SYJ2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prr27Q3SYJ2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prr27Q3SYJ2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prr27Q3SYJ2 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prr27Q3SYJ2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prr27Q3SYJ2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prr27Q3SYJ2 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prr27Q3SYJ2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prr27Q3SYJ2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prr27Q3SYJ2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prr27Q3SYJ2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prr27Q3SYJ2 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prr27Q3SYJ2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prr27Q3SYJ2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prr27Q3SYJ2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prr27Q3SYJ2 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Prr27Q3SYJ2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prr27Q3SYJ2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Prr27Q3SYJ2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prr27Q3SYJ2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prr27Q3SYJ2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prr27Q3SYJ2 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prr27Q3SYJ2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prr27Q3SYJ2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prr27Q3SYJ2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prr27Q3SYJ2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prr27Q3SYJ2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prr27Q3SYJ2 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prr27Q3SYJ2 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prr27Q3SYJ2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms