Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hddc2Q3SXD3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hddc2Q3SXD3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hddc2Q3SXD3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hddc2Q3SXD3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hddc2Q3SXD3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hddc2Q3SXD3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hddc2Q3SXD3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hddc2Q3SXD3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hddc2Q3SXD3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hddc2Q3SXD3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hddc2Q3SXD3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hddc2Q3SXD3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Hddc2Q3SXD3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hddc2Q3SXD3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hddc2Q3SXD3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Hddc2Q3SXD3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hddc2Q3SXD3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hddc2Q3SXD3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hddc2Q3SXD3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hddc2Q3SXD3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hddc2Q3SXD3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hddc2Q3SXD3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hddc2Q3SXD3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hddc2Q3SXD3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hddc2Q3SXD3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hddc2Q3SXD3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hddc2Q3SXD3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hddc2Q3SXD3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hddc2Q3SXD3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hddc2Q3SXD3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hddc2Q3SXD3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hddc2Q3SXD3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hddc2Q3SXD3 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Hddc2Q3SXD3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hddc2Q3SXD3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hddc2Q3SXD3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hddc2Q3SXD3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hddc2Q3SXD3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hddc2Q3SXD3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hddc2Q3SXD3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hddc2Q3SXD3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hddc2Q3SXD3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hddc2Q3SXD3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hddc2Q3SXD3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Hddc2Q3SXD3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hddc2Q3SXD3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hddc2Q3SXD3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hddc2Q3SXD3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hddc2Q3SXD3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hddc2Q3SXD3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hddc2Q3SXD3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hddc2Q3SXD3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hddc2Q3SXD3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hddc2Q3SXD3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hddc2Q3SXD3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hddc2Q3SXD3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hddc2Q3SXD3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hddc2Q3SXD3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Hddc2Q3SXD3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hddc2Q3SXD3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hddc2Q3SXD3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hddc2Q3SXD3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hddc2Q3SXD3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hddc2Q3SXD3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hddc2Q3SXD3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hddc2Q3SXD3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hddc2Q3SXD3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hddc2Q3SXD3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hddc2Q3SXD3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Hddc2Q3SXD3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hddc2Q3SXD3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hddc2Q3SXD3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Hddc2Q3SXD3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hddc2Q3SXD3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hddc2Q3SXD3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hddc2Q3SXD3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hddc2Q3SXD3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hddc2Q3SXD3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hddc2Q3SXD3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hddc2Q3SXD3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hddc2Q3SXD3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hddc2Q3SXD3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hddc2Q3SXD3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hddc2Q3SXD3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hddc2Q3SXD3 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hddc2Q3SXD3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hddc2Q3SXD3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hddc2Q3SXD3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hddc2Q3SXD3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hddc2Q3SXD3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hddc2Q3SXD3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hddc2Q3SXD3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hddc2Q3SXD3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hddc2Q3SXD3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Hddc2Q3SXD3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hddc2Q3SXD3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hddc2Q3SXD3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hddc2Q3SXD3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hddc2Q3SXD3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms