Protein–RNA interactions for Protein: Q30D77

Col24a1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col24a1Q30D77 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col24a1Q30D77 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col24a1Q30D77 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col24a1Q30D77 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col24a1Q30D77 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col24a1Q30D77 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col24a1Q30D77 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col24a1Q30D77 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col24a1Q30D77 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col24a1Q30D77 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col24a1Q30D77 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col24a1Q30D77 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col24a1Q30D77 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col24a1Q30D77 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Col24a1Q30D77 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col24a1Q30D77 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col24a1Q30D77 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col24a1Q30D77 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col24a1Q30D77 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col24a1Q30D77 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Col24a1Q30D77 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col24a1Q30D77 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col24a1Q30D77 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col24a1Q30D77 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col24a1Q30D77 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col24a1Q30D77 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col24a1Q30D77 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col24a1Q30D77 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col24a1Q30D77 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col24a1Q30D77 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col24a1Q30D77 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col24a1Q30D77 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col24a1Q30D77 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col24a1Q30D77 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col24a1Q30D77 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col24a1Q30D77 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col24a1Q30D77 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col24a1Q30D77 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col24a1Q30D77 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col24a1Q30D77 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col24a1Q30D77 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col24a1Q30D77 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col24a1Q30D77 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col24a1Q30D77 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col24a1Q30D77 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col24a1Q30D77 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col24a1Q30D77 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col24a1Q30D77 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col24a1Q30D77 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col24a1Q30D77 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col24a1Q30D77 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col24a1Q30D77 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col24a1Q30D77 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col24a1Q30D77 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col24a1Q30D77 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col24a1Q30D77 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col24a1Q30D77 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Col24a1Q30D77 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col24a1Q30D77 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col24a1Q30D77 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Col24a1Q30D77 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col24a1Q30D77 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col24a1Q30D77 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col24a1Q30D77 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Col24a1Q30D77 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Col24a1Q30D77 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col24a1Q30D77 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Col24a1Q30D77 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col24a1Q30D77 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col24a1Q30D77 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Col24a1Q30D77 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
Col24a1Q30D77 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Col24a1Q30D77 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Col24a1Q30D77 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Col24a1Q30D77 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Col24a1Q30D77 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Col24a1Q30D77 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col24a1Q30D77 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col24a1Q30D77 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col24a1Q30D77 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Col24a1Q30D77 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col24a1Q30D77 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Col24a1Q30D77 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col24a1Q30D77 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col24a1Q30D77 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col24a1Q30D77 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col24a1Q30D77 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col24a1Q30D77 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col24a1Q30D77 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col24a1Q30D77 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col24a1Q30D77 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col24a1Q30D77 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col24a1Q30D77 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col24a1Q30D77 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col24a1Q30D77 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col24a1Q30D77 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col24a1Q30D77 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col24a1Q30D77 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col24a1Q30D77 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col24a1Q30D77 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms