Protein–RNA interactions for Protein: Q2MKA5

Chrna5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna5Q2MKA5 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chrna5Q2MKA5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chrna5Q2MKA5 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chrna5Q2MKA5 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chrna5Q2MKA5 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chrna5Q2MKA5 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chrna5Q2MKA5 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chrna5Q2MKA5 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chrna5Q2MKA5 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chrna5Q2MKA5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chrna5Q2MKA5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chrna5Q2MKA5 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chrna5Q2MKA5 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chrna5Q2MKA5 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chrna5Q2MKA5 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chrna5Q2MKA5 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chrna5Q2MKA5 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chrna5Q2MKA5 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Chrna5Q2MKA5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chrna5Q2MKA5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chrna5Q2MKA5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chrna5Q2MKA5 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chrna5Q2MKA5 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Chrna5Q2MKA5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chrna5Q2MKA5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chrna5Q2MKA5 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chrna5Q2MKA5 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chrna5Q2MKA5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chrna5Q2MKA5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chrna5Q2MKA5 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chrna5Q2MKA5 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chrna5Q2MKA5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chrna5Q2MKA5 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chrna5Q2MKA5 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chrna5Q2MKA5 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chrna5Q2MKA5 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chrna5Q2MKA5 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chrna5Q2MKA5 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Chrna5Q2MKA5 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Chrna5Q2MKA5 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chrna5Q2MKA5 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chrna5Q2MKA5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chrna5Q2MKA5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chrna5Q2MKA5 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Chrna5Q2MKA5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chrna5Q2MKA5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chrna5Q2MKA5 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Chrna5Q2MKA5 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Chrna5Q2MKA5 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chrna5Q2MKA5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chrna5Q2MKA5 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chrna5Q2MKA5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chrna5Q2MKA5 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chrna5Q2MKA5 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chrna5Q2MKA5 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chrna5Q2MKA5 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chrna5Q2MKA5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chrna5Q2MKA5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chrna5Q2MKA5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chrna5Q2MKA5 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chrna5Q2MKA5 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chrna5Q2MKA5 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Chrna5Q2MKA5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chrna5Q2MKA5 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Chrna5Q2MKA5 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chrna5Q2MKA5 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chrna5Q2MKA5 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chrna5Q2MKA5 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chrna5Q2MKA5 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chrna5Q2MKA5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chrna5Q2MKA5 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chrna5Q2MKA5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chrna5Q2MKA5 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chrna5Q2MKA5 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chrna5Q2MKA5 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chrna5Q2MKA5 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chrna5Q2MKA5 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Chrna5Q2MKA5 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chrna5Q2MKA5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chrna5Q2MKA5 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chrna5Q2MKA5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chrna5Q2MKA5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chrna5Q2MKA5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chrna5Q2MKA5 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chrna5Q2MKA5 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Chrna5Q2MKA5 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chrna5Q2MKA5 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chrna5Q2MKA5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chrna5Q2MKA5 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chrna5Q2MKA5 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chrna5Q2MKA5 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chrna5Q2MKA5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chrna5Q2MKA5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chrna5Q2MKA5 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chrna5Q2MKA5 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chrna5Q2MKA5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chrna5Q2MKA5 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Chrna5Q2MKA5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chrna5Q2MKA5 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chrna5Q2MKA5 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms