Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim71Q1PSW8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim71Q1PSW8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim71Q1PSW8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim71Q1PSW8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim71Q1PSW8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim71Q1PSW8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim71Q1PSW8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim71Q1PSW8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim71Q1PSW8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim71Q1PSW8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim71Q1PSW8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim71Q1PSW8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim71Q1PSW8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim71Q1PSW8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim71Q1PSW8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim71Q1PSW8 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim71Q1PSW8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim71Q1PSW8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim71Q1PSW8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim71Q1PSW8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim71Q1PSW8 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim71Q1PSW8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim71Q1PSW8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim71Q1PSW8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim71Q1PSW8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim71Q1PSW8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim71Q1PSW8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim71Q1PSW8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim71Q1PSW8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim71Q1PSW8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim71Q1PSW8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim71Q1PSW8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim71Q1PSW8 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim71Q1PSW8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim71Q1PSW8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim71Q1PSW8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim71Q1PSW8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim71Q1PSW8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim71Q1PSW8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim71Q1PSW8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim71Q1PSW8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim71Q1PSW8 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim71Q1PSW8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim71Q1PSW8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim71Q1PSW8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim71Q1PSW8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim71Q1PSW8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim71Q1PSW8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim71Q1PSW8 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim71Q1PSW8 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim71Q1PSW8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim71Q1PSW8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim71Q1PSW8 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim71Q1PSW8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim71Q1PSW8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trim71Q1PSW8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trim71Q1PSW8 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim71Q1PSW8 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim71Q1PSW8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim71Q1PSW8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim71Q1PSW8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim71Q1PSW8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim71Q1PSW8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim71Q1PSW8 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim71Q1PSW8 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim71Q1PSW8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim71Q1PSW8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim71Q1PSW8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim71Q1PSW8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim71Q1PSW8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim71Q1PSW8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim71Q1PSW8 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim71Q1PSW8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim71Q1PSW8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim71Q1PSW8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim71Q1PSW8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim71Q1PSW8 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim71Q1PSW8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim71Q1PSW8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim71Q1PSW8 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim71Q1PSW8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim71Q1PSW8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim71Q1PSW8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim71Q1PSW8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim71Q1PSW8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim71Q1PSW8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim71Q1PSW8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim71Q1PSW8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim71Q1PSW8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim71Q1PSW8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim71Q1PSW8 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim71Q1PSW8 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim71Q1PSW8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim71Q1PSW8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim71Q1PSW8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim71Q1PSW8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trim71Q1PSW8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trim71Q1PSW8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trim71Q1PSW8 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.4 ms