Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpusd3Q14AI6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpusd3Q14AI6 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpusd3Q14AI6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpusd3Q14AI6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpusd3Q14AI6 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpusd3Q14AI6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpusd3Q14AI6 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpusd3Q14AI6 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpusd3Q14AI6 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpusd3Q14AI6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpusd3Q14AI6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpusd3Q14AI6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpusd3Q14AI6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpusd3Q14AI6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpusd3Q14AI6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpusd3Q14AI6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpusd3Q14AI6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpusd3Q14AI6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpusd3Q14AI6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpusd3Q14AI6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpusd3Q14AI6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpusd3Q14AI6 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpusd3Q14AI6 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpusd3Q14AI6 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpusd3Q14AI6 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpusd3Q14AI6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpusd3Q14AI6 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpusd3Q14AI6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpusd3Q14AI6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpusd3Q14AI6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpusd3Q14AI6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpusd3Q14AI6 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpusd3Q14AI6 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpusd3Q14AI6 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpusd3Q14AI6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rpusd3Q14AI6 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rpusd3Q14AI6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rpusd3Q14AI6 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rpusd3Q14AI6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rpusd3Q14AI6 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rpusd3Q14AI6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rpusd3Q14AI6 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpusd3Q14AI6 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpusd3Q14AI6 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpusd3Q14AI6 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpusd3Q14AI6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpusd3Q14AI6 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpusd3Q14AI6 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpusd3Q14AI6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpusd3Q14AI6 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpusd3Q14AI6 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpusd3Q14AI6 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpusd3Q14AI6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpusd3Q14AI6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpusd3Q14AI6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpusd3Q14AI6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpusd3Q14AI6 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpusd3Q14AI6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpusd3Q14AI6 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpusd3Q14AI6 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpusd3Q14AI6 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Rpusd3Q14AI6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpusd3Q14AI6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpusd3Q14AI6 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpusd3Q14AI6 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpusd3Q14AI6 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpusd3Q14AI6 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpusd3Q14AI6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpusd3Q14AI6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpusd3Q14AI6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpusd3Q14AI6 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpusd3Q14AI6 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpusd3Q14AI6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpusd3Q14AI6 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpusd3Q14AI6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpusd3Q14AI6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpusd3Q14AI6 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpusd3Q14AI6 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpusd3Q14AI6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpusd3Q14AI6 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpusd3Q14AI6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpusd3Q14AI6 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpusd3Q14AI6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpusd3Q14AI6 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpusd3Q14AI6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpusd3Q14AI6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpusd3Q14AI6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpusd3Q14AI6 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpusd3Q14AI6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpusd3Q14AI6 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpusd3Q14AI6 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpusd3Q14AI6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpusd3Q14AI6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpusd3Q14AI6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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