Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rpusd2Q149F1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rpusd2Q149F1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rpusd2Q149F1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rpusd2Q149F1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rpusd2Q149F1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rpusd2Q149F1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rpusd2Q149F1 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Rpusd2Q149F1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rpusd2Q149F1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rpusd2Q149F1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rpusd2Q149F1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rpusd2Q149F1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rpusd2Q149F1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rpusd2Q149F1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rpusd2Q149F1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rpusd2Q149F1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rpusd2Q149F1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rpusd2Q149F1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rpusd2Q149F1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rpusd2Q149F1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rpusd2Q149F1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rpusd2Q149F1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Rpusd2Q149F1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rpusd2Q149F1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rpusd2Q149F1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rpusd2Q149F1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rpusd2Q149F1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rpusd2Q149F1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rpusd2Q149F1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rpusd2Q149F1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rpusd2Q149F1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rpusd2Q149F1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rpusd2Q149F1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rpusd2Q149F1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rpusd2Q149F1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rpusd2Q149F1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Rpusd2Q149F1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rpusd2Q149F1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rpusd2Q149F1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rpusd2Q149F1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rpusd2Q149F1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rpusd2Q149F1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rpusd2Q149F1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rpusd2Q149F1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Rpusd2Q149F1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rpusd2Q149F1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rpusd2Q149F1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rpusd2Q149F1 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rpusd2Q149F1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rpusd2Q149F1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rpusd2Q149F1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rpusd2Q149F1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rpusd2Q149F1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rpusd2Q149F1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rpusd2Q149F1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rpusd2Q149F1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rpusd2Q149F1 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rpusd2Q149F1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rpusd2Q149F1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rpusd2Q149F1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rpusd2Q149F1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rpusd2Q149F1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Rpusd2Q149F1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpusd2Q149F1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpusd2Q149F1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpusd2Q149F1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpusd2Q149F1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpusd2Q149F1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpusd2Q149F1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpusd2Q149F1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpusd2Q149F1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpusd2Q149F1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpusd2Q149F1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpusd2Q149F1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpusd2Q149F1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpusd2Q149F1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpusd2Q149F1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rpusd2Q149F1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rpusd2Q149F1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rpusd2Q149F1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rpusd2Q149F1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rpusd2Q149F1 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rpusd2Q149F1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Rpusd2Q149F1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rpusd2Q149F1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Rpusd2Q149F1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rpusd2Q149F1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rpusd2Q149F1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rpusd2Q149F1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rpusd2Q149F1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rpusd2Q149F1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rpusd2Q149F1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rpusd2Q149F1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rpusd2Q149F1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rpusd2Q149F1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rpusd2Q149F1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rpusd2Q149F1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rpusd2Q149F1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rpusd2Q149F1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms