Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIK3Q13003 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIK3Q13003 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIK3Q13003 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIK3Q13003 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIK3Q13003 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIK3Q13003 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIK3Q13003 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIK3Q13003 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIK3Q13003 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIK3Q13003 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIK3Q13003 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIK3Q13003 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIK3Q13003 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIK3Q13003 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIK3Q13003 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIK3Q13003 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIK3Q13003 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIK3Q13003 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIK3Q13003 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIK3Q13003 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIK3Q13003 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIK3Q13003 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIK3Q13003 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIK3Q13003 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIK3Q13003 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIK3Q13003 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIK3Q13003 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIK3Q13003 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIK3Q13003 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIK3Q13003 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIK3Q13003 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIK3Q13003 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIK3Q13003 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIK3Q13003 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIK3Q13003 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GRIK3Q13003 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
GRIK3Q13003 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GRIK3Q13003 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIK3Q13003 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIK3Q13003 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIK3Q13003 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIK3Q13003 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIK3Q13003 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIK3Q13003 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIK3Q13003 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIK3Q13003 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIK3Q13003 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIK3Q13003 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIK3Q13003 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIK3Q13003 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIK3Q13003 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIK3Q13003 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIK3Q13003 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIK3Q13003 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIK3Q13003 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIK3Q13003 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIK3Q13003 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIK3Q13003 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIK3Q13003 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIK3Q13003 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIK3Q13003 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIK3Q13003 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIK3Q13003 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIK3Q13003 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIK3Q13003 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIK3Q13003 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIK3Q13003 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIK3Q13003 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIK3Q13003 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIK3Q13003 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIK3Q13003 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIK3Q13003 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIK3Q13003 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIK3Q13003 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIK3Q13003 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIK3Q13003 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIK3Q13003 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIK3Q13003 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIK3Q13003 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIK3Q13003 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIK3Q13003 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIK3Q13003 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIK3Q13003 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIK3Q13003 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIK3Q13003 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIK3Q13003 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIK3Q13003 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIK3Q13003 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIK3Q13003 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIK3Q13003 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIK3Q13003 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIK3Q13003 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIK3Q13003 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIK3Q13003 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIK3Q13003 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIK3Q13003 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIK3Q13003 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIK3Q13003 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIK3Q13003 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
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