Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ttc39dQ0VF76 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ttc39dQ0VF76 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ttc39dQ0VF76 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ttc39dQ0VF76 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ttc39dQ0VF76 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ttc39dQ0VF76 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ttc39dQ0VF76 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ttc39dQ0VF76 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ttc39dQ0VF76 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ttc39dQ0VF76 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ttc39dQ0VF76 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ttc39dQ0VF76 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ttc39dQ0VF76 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ttc39dQ0VF76 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ttc39dQ0VF76 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ttc39dQ0VF76 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ttc39dQ0VF76 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ttc39dQ0VF76 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ttc39dQ0VF76 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ttc39dQ0VF76 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ttc39dQ0VF76 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ttc39dQ0VF76 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ttc39dQ0VF76 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ttc39dQ0VF76 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ttc39dQ0VF76 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ttc39dQ0VF76 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ttc39dQ0VF76 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ttc39dQ0VF76 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ttc39dQ0VF76 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ttc39dQ0VF76 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ttc39dQ0VF76 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ttc39dQ0VF76 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ttc39dQ0VF76 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ttc39dQ0VF76 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ttc39dQ0VF76 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ttc39dQ0VF76 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ttc39dQ0VF76 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ttc39dQ0VF76 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ttc39dQ0VF76 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ttc39dQ0VF76 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ttc39dQ0VF76 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ttc39dQ0VF76 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ttc39dQ0VF76 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ttc39dQ0VF76 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ttc39dQ0VF76 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ttc39dQ0VF76 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ttc39dQ0VF76 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ttc39dQ0VF76 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ttc39dQ0VF76 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ttc39dQ0VF76 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ttc39dQ0VF76 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ttc39dQ0VF76 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ttc39dQ0VF76 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ttc39dQ0VF76 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ttc39dQ0VF76 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ttc39dQ0VF76 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ttc39dQ0VF76 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ttc39dQ0VF76 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ttc39dQ0VF76 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ttc39dQ0VF76 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ttc39dQ0VF76 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ttc39dQ0VF76 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ttc39dQ0VF76 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ttc39dQ0VF76 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ttc39dQ0VF76 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ttc39dQ0VF76 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ttc39dQ0VF76 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ttc39dQ0VF76 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ttc39dQ0VF76 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ttc39dQ0VF76 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ttc39dQ0VF76 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ttc39dQ0VF76 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ttc39dQ0VF76 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ttc39dQ0VF76 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ttc39dQ0VF76 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ttc39dQ0VF76 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ttc39dQ0VF76 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ttc39dQ0VF76 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ttc39dQ0VF76 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ttc39dQ0VF76 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ttc39dQ0VF76 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ttc39dQ0VF76 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ttc39dQ0VF76 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ttc39dQ0VF76 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ttc39dQ0VF76 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ttc39dQ0VF76 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ttc39dQ0VF76 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ttc39dQ0VF76 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ttc39dQ0VF76 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ttc39dQ0VF76 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ttc39dQ0VF76 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ttc39dQ0VF76 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ttc39dQ0VF76 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ttc39dQ0VF76 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ttc39dQ0VF76 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ttc39dQ0VF76 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ttc39dQ0VF76 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ttc39dQ0VF76 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ttc39dQ0VF76 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
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