Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab42Q0PD08 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab42Q0PD08 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab42Q0PD08 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab42Q0PD08 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab42Q0PD08 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab42Q0PD08 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab42Q0PD08 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab42Q0PD08 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab42Q0PD08 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab42Q0PD08 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab42Q0PD08 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab42Q0PD08 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab42Q0PD08 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab42Q0PD08 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab42Q0PD08 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab42Q0PD08 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab42Q0PD08 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab42Q0PD08 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab42Q0PD08 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab42Q0PD08 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab42Q0PD08 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab42Q0PD08 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab42Q0PD08 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab42Q0PD08 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab42Q0PD08 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab42Q0PD08 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rab42Q0PD08 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab42Q0PD08 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab42Q0PD08 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab42Q0PD08 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab42Q0PD08 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab42Q0PD08 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab42Q0PD08 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab42Q0PD08 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab42Q0PD08 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab42Q0PD08 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab42Q0PD08 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab42Q0PD08 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab42Q0PD08 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab42Q0PD08 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab42Q0PD08 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab42Q0PD08 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab42Q0PD08 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab42Q0PD08 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab42Q0PD08 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab42Q0PD08 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab42Q0PD08 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab42Q0PD08 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab42Q0PD08 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab42Q0PD08 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab42Q0PD08 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab42Q0PD08 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab42Q0PD08 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab42Q0PD08 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab42Q0PD08 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab42Q0PD08 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab42Q0PD08 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab42Q0PD08 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab42Q0PD08 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab42Q0PD08 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab42Q0PD08 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab42Q0PD08 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab42Q0PD08 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab42Q0PD08 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab42Q0PD08 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab42Q0PD08 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab42Q0PD08 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab42Q0PD08 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab42Q0PD08 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab42Q0PD08 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab42Q0PD08 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab42Q0PD08 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab42Q0PD08 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab42Q0PD08 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab42Q0PD08 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab42Q0PD08 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab42Q0PD08 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab42Q0PD08 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab42Q0PD08 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab42Q0PD08 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab42Q0PD08 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab42Q0PD08 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab42Q0PD08 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab42Q0PD08 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab42Q0PD08 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab42Q0PD08 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab42Q0PD08 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab42Q0PD08 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab42Q0PD08 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab42Q0PD08 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab42Q0PD08 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab42Q0PD08 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab42Q0PD08 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab42Q0PD08 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab42Q0PD08 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab42Q0PD08 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab42Q0PD08 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab42Q0PD08 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab42Q0PD08 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms