Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5V2

Sobp, Sine oculis-binding protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 864 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SobpQ0P5V2 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SobpQ0P5V2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SobpQ0P5V2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SobpQ0P5V2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SobpQ0P5V2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SobpQ0P5V2 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SobpQ0P5V2 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SobpQ0P5V2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SobpQ0P5V2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SobpQ0P5V2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SobpQ0P5V2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SobpQ0P5V2 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SobpQ0P5V2 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SobpQ0P5V2 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SobpQ0P5V2 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SobpQ0P5V2 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SobpQ0P5V2 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SobpQ0P5V2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SobpQ0P5V2 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SobpQ0P5V2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SobpQ0P5V2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SobpQ0P5V2 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SobpQ0P5V2 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SobpQ0P5V2 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SobpQ0P5V2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SobpQ0P5V2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SobpQ0P5V2 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SobpQ0P5V2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SobpQ0P5V2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SobpQ0P5V2 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SobpQ0P5V2 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SobpQ0P5V2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SobpQ0P5V2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SobpQ0P5V2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SobpQ0P5V2 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SobpQ0P5V2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SobpQ0P5V2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SobpQ0P5V2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SobpQ0P5V2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SobpQ0P5V2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SobpQ0P5V2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SobpQ0P5V2 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SobpQ0P5V2 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SobpQ0P5V2 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SobpQ0P5V2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SobpQ0P5V2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SobpQ0P5V2 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SobpQ0P5V2 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SobpQ0P5V2 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SobpQ0P5V2 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SobpQ0P5V2 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SobpQ0P5V2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SobpQ0P5V2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SobpQ0P5V2 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SobpQ0P5V2 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SobpQ0P5V2 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SobpQ0P5V2 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SobpQ0P5V2 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SobpQ0P5V2 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SobpQ0P5V2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SobpQ0P5V2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SobpQ0P5V2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SobpQ0P5V2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SobpQ0P5V2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SobpQ0P5V2 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SobpQ0P5V2 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SobpQ0P5V2 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SobpQ0P5V2 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SobpQ0P5V2 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SobpQ0P5V2 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SobpQ0P5V2 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SobpQ0P5V2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SobpQ0P5V2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SobpQ0P5V2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SobpQ0P5V2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SobpQ0P5V2 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SobpQ0P5V2 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SobpQ0P5V2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SobpQ0P5V2 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SobpQ0P5V2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SobpQ0P5V2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SobpQ0P5V2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SobpQ0P5V2 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SobpQ0P5V2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SobpQ0P5V2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SobpQ0P5V2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SobpQ0P5V2 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SobpQ0P5V2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SobpQ0P5V2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SobpQ0P5V2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SobpQ0P5V2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SobpQ0P5V2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SobpQ0P5V2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SobpQ0P5V2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SobpQ0P5V2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SobpQ0P5V2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SobpQ0P5V2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SobpQ0P5V2 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SobpQ0P5V2 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SobpQ0P5V2 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 234.8 ms