Protein–RNA interactions for Protein: Q08652

Rbp2, Retinol-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp2Q08652 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbp2Q08652 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbp2Q08652 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbp2Q08652 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbp2Q08652 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbp2Q08652 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbp2Q08652 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbp2Q08652 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbp2Q08652 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbp2Q08652 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbp2Q08652 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbp2Q08652 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbp2Q08652 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbp2Q08652 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbp2Q08652 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbp2Q08652 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbp2Q08652 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbp2Q08652 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbp2Q08652 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbp2Q08652 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbp2Q08652 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbp2Q08652 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbp2Q08652 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbp2Q08652 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbp2Q08652 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbp2Q08652 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbp2Q08652 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbp2Q08652 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbp2Q08652 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbp2Q08652 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbp2Q08652 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbp2Q08652 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbp2Q08652 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbp2Q08652 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbp2Q08652 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbp2Q08652 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbp2Q08652 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbp2Q08652 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbp2Q08652 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbp2Q08652 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbp2Q08652 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbp2Q08652 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbp2Q08652 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbp2Q08652 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbp2Q08652 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbp2Q08652 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbp2Q08652 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbp2Q08652 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbp2Q08652 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbp2Q08652 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbp2Q08652 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbp2Q08652 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbp2Q08652 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbp2Q08652 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbp2Q08652 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbp2Q08652 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbp2Q08652 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbp2Q08652 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbp2Q08652 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbp2Q08652 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbp2Q08652 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbp2Q08652 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbp2Q08652 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbp2Q08652 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbp2Q08652 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbp2Q08652 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbp2Q08652 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbp2Q08652 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbp2Q08652 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbp2Q08652 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbp2Q08652 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbp2Q08652 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbp2Q08652 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbp2Q08652 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbp2Q08652 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbp2Q08652 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbp2Q08652 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbp2Q08652 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbp2Q08652 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbp2Q08652 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbp2Q08652 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbp2Q08652 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbp2Q08652 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbp2Q08652 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbp2Q08652 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbp2Q08652 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbp2Q08652 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rbp2Q08652 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbp2Q08652 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbp2Q08652 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbp2Q08652 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbp2Q08652 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbp2Q08652 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbp2Q08652 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbp2Q08652 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbp2Q08652 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbp2Q08652 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbp2Q08652 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbp2Q08652 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbp2Q08652 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms