Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxc4Q08624 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxc4Q08624 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxc4Q08624 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxc4Q08624 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxc4Q08624 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxc4Q08624 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxc4Q08624 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxc4Q08624 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxc4Q08624 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxc4Q08624 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxc4Q08624 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxc4Q08624 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxc4Q08624 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxc4Q08624 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxc4Q08624 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxc4Q08624 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxc4Q08624 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxc4Q08624 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxc4Q08624 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxc4Q08624 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxc4Q08624 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxc4Q08624 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxc4Q08624 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxc4Q08624 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxc4Q08624 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxc4Q08624 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxc4Q08624 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxc4Q08624 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxc4Q08624 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxc4Q08624 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxc4Q08624 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxc4Q08624 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxc4Q08624 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxc4Q08624 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxc4Q08624 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxc4Q08624 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxc4Q08624 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxc4Q08624 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxc4Q08624 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxc4Q08624 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxc4Q08624 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxc4Q08624 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxc4Q08624 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxc4Q08624 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxc4Q08624 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxc4Q08624 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxc4Q08624 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxc4Q08624 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxc4Q08624 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxc4Q08624 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxc4Q08624 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxc4Q08624 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxc4Q08624 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxc4Q08624 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxc4Q08624 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxc4Q08624 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxc4Q08624 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxc4Q08624 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxc4Q08624 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxc4Q08624 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxc4Q08624 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxc4Q08624 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hoxc4Q08624 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hoxc4Q08624 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hoxc4Q08624 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxc4Q08624 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxc4Q08624 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxc4Q08624 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxc4Q08624 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxc4Q08624 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxc4Q08624 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxc4Q08624 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxc4Q08624 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxc4Q08624 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxc4Q08624 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxc4Q08624 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxc4Q08624 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxc4Q08624 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxc4Q08624 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxc4Q08624 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxc4Q08624 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxc4Q08624 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxc4Q08624 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxc4Q08624 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxc4Q08624 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxc4Q08624 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxc4Q08624 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxc4Q08624 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxc4Q08624 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxc4Q08624 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxc4Q08624 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxc4Q08624 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxc4Q08624 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxc4Q08624 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxc4Q08624 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxc4Q08624 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxc4Q08624 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxc4Q08624 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxc4Q08624 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms