Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AmbpQ07456 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AmbpQ07456 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AmbpQ07456 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AmbpQ07456 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AmbpQ07456 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AmbpQ07456 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AmbpQ07456 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AmbpQ07456 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AmbpQ07456 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AmbpQ07456 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AmbpQ07456 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AmbpQ07456 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AmbpQ07456 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AmbpQ07456 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AmbpQ07456 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AmbpQ07456 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AmbpQ07456 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AmbpQ07456 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AmbpQ07456 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AmbpQ07456 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AmbpQ07456 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AmbpQ07456 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AmbpQ07456 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AmbpQ07456 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
AmbpQ07456 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AmbpQ07456 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AmbpQ07456 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AmbpQ07456 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AmbpQ07456 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AmbpQ07456 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AmbpQ07456 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AmbpQ07456 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AmbpQ07456 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AmbpQ07456 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AmbpQ07456 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
AmbpQ07456 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AmbpQ07456 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AmbpQ07456 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AmbpQ07456 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
AmbpQ07456 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AmbpQ07456 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AmbpQ07456 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AmbpQ07456 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AmbpQ07456 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AmbpQ07456 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AmbpQ07456 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AmbpQ07456 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AmbpQ07456 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AmbpQ07456 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AmbpQ07456 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
AmbpQ07456 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
AmbpQ07456 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AmbpQ07456 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AmbpQ07456 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AmbpQ07456 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AmbpQ07456 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AmbpQ07456 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AmbpQ07456 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
AmbpQ07456 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
AmbpQ07456 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
AmbpQ07456 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
AmbpQ07456 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AmbpQ07456 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AmbpQ07456 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AmbpQ07456 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AmbpQ07456 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AmbpQ07456 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AmbpQ07456 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AmbpQ07456 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AmbpQ07456 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AmbpQ07456 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
AmbpQ07456 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AmbpQ07456 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AmbpQ07456 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AmbpQ07456 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AmbpQ07456 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AmbpQ07456 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AmbpQ07456 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AmbpQ07456 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AmbpQ07456 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AmbpQ07456 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AmbpQ07456 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AmbpQ07456 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AmbpQ07456 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AmbpQ07456 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AmbpQ07456 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AmbpQ07456 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AmbpQ07456 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AmbpQ07456 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AmbpQ07456 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
AmbpQ07456 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
AmbpQ07456 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AmbpQ07456 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AmbpQ07456 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AmbpQ07456 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AmbpQ07456 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AmbpQ07456 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AmbpQ07456 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AmbpQ07456 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms