Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cntn3Q07409 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cntn3Q07409 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cntn3Q07409 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cntn3Q07409 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cntn3Q07409 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cntn3Q07409 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cntn3Q07409 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cntn3Q07409 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cntn3Q07409 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cntn3Q07409 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cntn3Q07409 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cntn3Q07409 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cntn3Q07409 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cntn3Q07409 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cntn3Q07409 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cntn3Q07409 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cntn3Q07409 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cntn3Q07409 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cntn3Q07409 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cntn3Q07409 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cntn3Q07409 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cntn3Q07409 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cntn3Q07409 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cntn3Q07409 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cntn3Q07409 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cntn3Q07409 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cntn3Q07409 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cntn3Q07409 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cntn3Q07409 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cntn3Q07409 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cntn3Q07409 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cntn3Q07409 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cntn3Q07409 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cntn3Q07409 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cntn3Q07409 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cntn3Q07409 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cntn3Q07409 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cntn3Q07409 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cntn3Q07409 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cntn3Q07409 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cntn3Q07409 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cntn3Q07409 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cntn3Q07409 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cntn3Q07409 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cntn3Q07409 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cntn3Q07409 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cntn3Q07409 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Cntn3Q07409 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cntn3Q07409 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cntn3Q07409 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cntn3Q07409 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cntn3Q07409 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cntn3Q07409 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cntn3Q07409 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cntn3Q07409 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cntn3Q07409 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cntn3Q07409 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cntn3Q07409 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cntn3Q07409 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Cntn3Q07409 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cntn3Q07409 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cntn3Q07409 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cntn3Q07409 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cntn3Q07409 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cntn3Q07409 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cntn3Q07409 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cntn3Q07409 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cntn3Q07409 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cntn3Q07409 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cntn3Q07409 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cntn3Q07409 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Cntn3Q07409 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cntn3Q07409 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cntn3Q07409 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cntn3Q07409 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cntn3Q07409 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cntn3Q07409 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cntn3Q07409 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cntn3Q07409 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cntn3Q07409 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cntn3Q07409 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cntn3Q07409 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cntn3Q07409 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cntn3Q07409 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cntn3Q07409 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cntn3Q07409 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cntn3Q07409 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cntn3Q07409 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cntn3Q07409 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cntn3Q07409 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cntn3Q07409 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cntn3Q07409 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Cntn3Q07409 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cntn3Q07409 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cntn3Q07409 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cntn3Q07409 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cntn3Q07409 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cntn3Q07409 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cntn3Q07409 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms